Basic Information
Symbol
hsa_RTN4_0005100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RTN4_0041
Host gene
RTN4
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:55240113-55240776
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:55012977-55013640
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-148.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-162.84 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
159.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........((((.......(((((..(.(((((...........(((((..(((((..((.(((.((((((.((......)).)))((((((.((((((((...............)))))))).))))))....(((((....(((..(.((((..(.(((((((((((..((((...(((.....)))..))))....)))))).....))))).)..)))))))).....)))))......))).))).))..))))).)))))(((((...(((....)))....))))).....))))).)..)))))....))))....(((((....(((((((.(....((...((((((((((((((........))).))))))).))))...))((((((((((..((((((..((((((...))))))((((((.((((.................((((((.(((((((...................(((((.....)))))...(((((((((.............))))))))))))))))...)))))))))).)))))))))))).))))))..))))...).))))))).(((((.(((.(....)))).))))).....)))))..........(((((((....))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{{{...((((.......(((((..(.(((((...,{,,{...(((((..(((((..((.(((.((({((.((......)).))}{(((((.((((((((.,,..........,.)))))))).)))))},{{,({{{({{{{(,...,,{(((,,{.((({({{{{{{,,|,{{.,,|||.,...}|}..})))....)))}}}..,,})))}},),,}})|||||,,...}))},.,,,..))).))).))..))))).))))),,,,|}}}|,,....|||{...,,,))},...))))).)..)))))....))))...}}},,.{((,((({(((.,....,|,..((({((((((((((........))))))))))).)))}...}|((((((((((..((((((..((((({...})))))((((((.((((.................((((({.(((((((,...............,,.(((((.....)))))..,{((((((((....,...,,...))))))))))))))))...)))))))))).)))))))))))).)))))}.,))))...,.)}}}},,.(((((.(((.{....,))).))))).....}})))}}}}...,.,(((((({....})))))),
Forensic Context
No forensic context available.