Basic Information

Symbol
hsa_chr2_0854600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RTN4_0085
Host gene
RTN4
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
2:55252291-55254623 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:55025155-55027487 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-593.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -638.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 598.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...((((((((((((((((((((.((((((..(((......)))(((.(((((..(((((((.........)))))))......))))))))....(((.(((((((((((((((((.((......(((((((((....((((((((((..((((((.((....((((((((.(((.(((((.((((..(((....)))..)))).)).))))))))))))))(((((....))))).......(((((((....)))))))..(((((((((((........))))))....)))))..(((.((((((....))))))))).)).)))))).((((((.((((....)))).)))))).............)))))))))).....((((((((...(((((.....(((.((.....((((.....((((((...((((((((......((((((((......))))..)))).....(.(((....))).)((((((((.((......)).))))))))....((((((...((((((((.......(((((((.((....)).)).)))))..((((((..........................))))))...((((((((...)))))))).......((((......))))...(((((((..((((....(((.....)))....)))).)))))))(((.((((((...)))))).))))))))))).....))))))(((((..(((((..((((((((..............(((((....)))))((((((.(((((..(((..(((((.(((((((.......((((((.((((.((((((((((((...((((((....))))))(((((((((...............))))))))).....(((((((((((((((((.........((((((((((((..((.((.((((....((((((.(((((((.........(((((....)))))....)))))))..))))))...)))).)))))))).))))))))(((((((((((((........))).........)))))))))).......))))))).......)))))))))).....(((((((((.......(((((..((((((((.....((((.((((((...((((.........((((((((((.((((......)))).))))..))).))).........))))..)))))).)))).....)))).))))))))).........)))))))))......((((....))))..((((.....)))).(((((((((..........((.((((.....)))).))(((((((...((......))...)))))))((((....(((.((((((...........)))))...).)))......................))))((((((((((....))))))))))...)))))))))....)))))))))))).....((((((((((...(((((((((((((((.(((...))).))))).........)))))).))))...)))).))))))((.((.((((.......)))).)).))............))))))))))....))))))).)))))..)))...........((((........)))).))))).))))))......))))))))..........................((((....((((..........))))..)))))))))..))))).........))))))))..))))))........)))).......)).)))......))))))))).))))((((((..(((((.............))))).)).))))(((....)))(((...((((((.((((........)))).)).))))...)))............)))).)))))......)).)))))))).)))).((((((((((((((.((((((((.....(((((((....))))...((((.(((.......))).)))).)))...))))..)))).))))))))))..))))...((((((.....)))))).....((((((((((((...)))))).....))))))((((((...........))))))))))).)))..)))))))))))))...)))))))))))))..)(((((((((...((((.(((((..(((((.((((...........)))))))))((((...............))))))))).))))...)))...))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{{{{{{{,{{{{{,{{(({,,..||||||,.|((({.....,.,||,|,.....(((((((,......}.)))))))......|(((((.{{{.((((((.((({((.(,((((((((({.....{(({(((({,..,{{{{|,.}|},))),)),..,,...))))}},,.|||||,|||}||,,.,(((,,,.}||,.,,,}.)),,,}})}})))))|{(((((....|||||{..{{..(((((((....)))))))..(((((((((((........)))))}....))))}..(({(((((((....}}|||||||.{{{(((||,.,{,|||,||,,..,.|,||{|||,||{.((((({...}))))).}))}}},...||||||,.||||}}......,}}}{{{.,,.,|||......{((((....(((...)))...))))|(((((......))))),,}},},},}}.|||....,,,..((((((((.((......)).))))))))...(((((((...((((((((......,(((((((.((....)).)).)))))..{((({{....,,,{,......,,,......,,|||}},...((((((((...)))))))}.{((((((((,{..,.{{......}}})},}}))))))}.,||||{{.{{||||,{,.|{,,,,,,))|,,.{|||||,,,,)))}),))})))))))).....)))))))..|||,|||.{..,|{|}}.},,.,,..,))).(((((((....)))))))..,},)))))))|||,,(((((.(((((((.......(((({{{((((.((((((((((((..,((((((....))))))|((((((((,.,..........,,)))))))),,,,,,((((((({(((((((((.........(((((((((((,.{({{((.((((....((((((.(((((((......,..,{{{{....}))}}....)))))))}.))))))...)))).)))))))).))))))))(((((((((((((........))).........)))))))))).......))))))).......))}))))))},.{,.,((((((((......,(((((..((((((((.....((((.((((((...((((...,,....((((((((((.((((......)))).))))..)))},))...},....))))..)))))).)))).....)))).))))))))).,.......)))))))))......((((....))))..((((.....)))).(((((((((..........{{.((((.....)))).))|{{{{{(...{{......)).,,))))))}{{.,....(((.{(((((..,......}.)))))...).)))......,,..................((((((((((....))))))))))...)))))))))....)))))))))))).....((((((((((,..(({{(((((((((((.(({...})).)))))}........}))))).}))}...)))).))))))((,(({((((.......)))).}}.,,....,,,,,...))))))))))....))))))).)))))..}},...........,,,,.,,.....)))}})))))..)))...)))))|(((((({....,.((((({.{{{.,.............(((((((.{{.,.{{...,,((((((((.{(((....,,(({{...,,|||||.,....,||||.,{{{,,,...........(((((((.,......,.)))))))..,{|,,,..,,,,,..,......,}}}})))).})}))},|||}}}})}}||,...|{{|||.((((........}}}|,||,||||.,.}}|.,,,,,.,{{{.{,...{{{{{{{..{((((((((((........))))))))))}.....)))))}}...}}}}.||||}...,,,,...((((.(((.......))).)))).{,.,{,.((({{{....,,)))))),})},}|((((((((...(((((({{(..(((((,,,((((((((...))))))}}.,.,|||||{{,{{|}}||..,....,,}}}|||||,|||,,.}},}}}))}},)))))..))))))))))...)))))))))|}}}||||.,}}})}}}}}}}},,|},}}}})))}}.,,,..,,},..||..}}}}))))).,...)))))))}.}}}}.,,,,}...,,,}))
Forensic Context

No forensic context available.