Basic Information

Symbol
hsa_RTN4_0007100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RTN4_0087
Host gene
RTN4
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:55252394-55254006 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:55025258-55026870 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-367.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -399.05 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 457.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..............((((........)))).....(((((((((((((((...(((((((((..((((.((........))))))(((((.((((.......)))).))))).((..((.(((....))).))..))...)))))(((((((((.....)))))))))........(((......))))).)).)))))..)))))))))))(((((.(((.((((((...((((..............))))...........((((((((((((.......((.(((((((((.........................)))))).))).))....(((....))).((((.....))))................(((((.((.(((((((..(((.((((....)))))))...(((((((........))).))))..(((((......(((.((((((.(((((..((...(((((....))).))...))......))))).))))))...))).....))))).((((...)))).)))).)))..)).)))))..(((((((((((((.((((..(((.((((((((.....((((((((....((((((((((((((((.........(((.(....).))))))))))))))))))))))....(((((.........((((((((.((((....(((((....)))))..((((.((((......................))))))))((((...)))).......(((.((((....(((((.(...((.((((((.((............)))))))).))..........))))))...(((((.(((..(((.((((((....(((((......)))))((((...))))..........(((((....)))))...((((...(((....)))...))))........(((((((....((((((((((((..((((((.(((((((((((.(((((....))))).))))...)))..))))(((((...((..((......))..)).)))))(((..(((((((...)))))))..))))))))).)))..(((((((......((......))....(((((.(..((...))..).)))))))))))))))))))))..))))))).)))))).)))))).))))).)))).))))))).)))))))).....)))))..((((((......)))))))))))))))))))...))).))).).))..))))))))))).(((((((.((((....))))...))))))).....((((((...))))))..((((((..(((....)))..))))))(((((((....(((((((((....)))))).)))...............)))))))....((((((((...((((((((....))).....((....))...)))))...))))))))..)))))(((......)))...(((..((((....))))..))).((((.....))))..((((((.....))))))......)))))))......)))))).)))...)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({....{({{(.{{.,{{{|..,,,..,}||,,....,,,,{{||||{{{|...||||{{{{{..(((,,((........))))))(((((.((((.......)))).))))).({.,((.{{{....})).)}..))...}}}},(((((((((.....))))))))).....,{{((({..{{.|||.|.||{|||||{..,,|||||||{((((({((({,,{{{|,.,{({{,,........,,..||.........,,.{{{{{{{(..{(......(((({.,......,..))))).................,))))))}|{||,,...,,|}},,||||.((((.....)))).....,}},..,,}}}}}}}}}{((((,.,,,|||||{(((,.,,,{({,,,..,|(((((((,,,.....}}}.}}}},,||||||(,,{{(((.((((((.(((((..|,,|,||,,,..,,))}.},...},......))))).)))))}...}},...,,}.|||,{(({...}}}}.|||}|}}|||,,,}}}}},.((((((((((({(,((((..(({.((((((({.,,,.{{{{{|||....((((((((((((((((.........(((.{....}.))))))))))))))))))),,}....(((((.......,.((((((((.((((....(((((....))))}..((((.((((......................))))))))((((...)))).......(((.((((.,,.{((({.,...{{.((((({,((............)))))))).,,..........})))))...{((({.{{{..{{{.{{{{{{....(((({.....,})))}((((...}))),...,.,,,,{((((....)))))...((({...{{{....,)),..}}))..|,,...(((((((....(((((((((....,..((((((...,,(((((((((,,,.{{(|,|,.|||.....))}.,}},|||{,..{(({(,{.....,,}.,}.})))),.,.,.{((((((...)))))))}.}}))))))))),.))))))..}......,{......}},.{.(((((.(,.((...)),.),)))))},,....)))))))))..))))))).,)}))).})})}}.})))}.)))).))))))).)))))))).....)))))..((((((,....,))))))))})))))))))).,.})).))).}.}},.})))))))))).(((((((.((((....))))...))))))).,,,.(((((,...}))))){{((((((..{{{....)))..))))))))|,,,.....,{(((((((....))))))))})}}},}.......},,}((({...((((........)))))))}.,,}}})))...}})).}})))..})),)).,))))))),,,}}}||||||.,....}}}..,|||,,||||||,,||}}......{{((,,,..}|||..((((({.....}))))).,,},,}))))),.....}))))})}}},,.,}})))
Forensic Context

No forensic context available.