Basic Information

Symbol
hsa_RTN4_0008000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-RTN4_0093
Host gene
RTN4
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:55283603-55285837 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:55056467-55058701 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-522.54 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -565.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 467.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...(((((((((........................)))))))))..)(((.....(((.......(((...(((((........((..(.((((((((...((((((((...................(((((((((......)))).))))).......(((...(((.....)))..)))(((....)))......))))))))..)))).)))).)..))((((.....))))........((.(((((((.....(((((((((((((((((((((.(((............((((((((((.((((........((.((((((((((((((((....((((...................)))).((((...((((..(((...((((((((((((..(((((((....)))))))...............(((((..((((...))))..)))))((((.....)))).((((.(((((.....(((((.(((((....(((((..............................................)))))))))))))))..))))).))))..))))).))))))).....(((((..(((.....)))..)))))......)))..))))..))))......))))))))))))..)))).)).....((((....(((((..........((((((((((((((((.(((((....(((..((((..(((((((((((.(((.((((((............))).)))))).)))))..((((.(((((.......)).)))))))(((((.(((.((((............((.............))...................((((..(((((..((......))..)))))..))))........((((..(((((......))))).))))...)))).))))))))....((((.((......)).))))((((..((((....)))))))).......................((((.......)))).......))))))..))))..)))..)))))))))))))))))))))......(((((.(((......))).)))))..((((((.......((((((((.......))))))))))))))...(((((.....)))))(((((.((((....)))).)))))...)))))....)))).))))...)))).))))))............))).)))).)))))))......(((((((((...(((((((((((((((((((.(((((.(((((((.(..((((.((((((.............((.(((((....(((((.((((......)))).))).)))))))))((((..(((((.((((...................(((((.....)))))............((((......))))((((((((((.............))))))))))(((((((((((...(((((((..(((..(((((.........)))))..)))....)))))))))))))))))).............)))).)))))..)))).((((((((((((................)).)))))))))).......((((((((((((((((((((.(((....((((((.((((.(((.(((.((.((..((((.((((((......)))))).))))..)).)).))).))).....(((((......)))))...))))))))))))).))...))).)))))))))))))))...(((((((.(.(((((....))))).).))))))).....((((((.((....)).))))))))))))..))))..).)).)))))............)))))))))))))......................(((((.....))))))))))..)))))).....))).))))))..........(((((((((((....(((((((((...))))))..)))....)))))))))))...((((((..((...(((((((((...))))))))).....))..)).))))........((.(((.....))).)))))))))))).....))))))).)).((((..(....)..))))....((((...........)))))))))...)))))).....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.,.(((((((((........................))))))))).,)(((.....(((.......(((...(((((..,{,,.....{{,,(((((((...((((((((......,,..,,{{,....(((((((((......)))))))))}......,|||...,{{.....))}..,,.(((....)))...,..))))))))..}))).))))||.|||({{{,.,.,||||{{....}}{|.{((((({.....{(((((((((({{({(((((...........,},.}}})}|{|||,,..|{{,,.,,(((((.....((((({{((,,......,({,......,...,.....}}))))))..,,,,,(((((({(((.{(((((((((({..(((((((....)))))))..............{(((((..((((...))))..)))))|(((.....}}},.((((.{{(((.....{{{{,{(((((,...(({{{.......,..........................,,,.........})))}}})))))))}..})))).))))..)))))}})))))),....(((((..(((.....)))..))))).....(((((((.((.(((((...((((((......{.((((....)))).......)))))).......................,{{(((({{(((,.,{(((.((..((({{{...(((((.(((.((((((............))),,))))).)))))}}))).)))))))}}})...,,,,|(((((..((,(((((.{(((((....{,.,{,.............}}....,,{{{{{.....)))}}}}..)))))}.))))).,))...)))))}.}}}},},.....((((..(((((......))))).))))...))))))).)))))))..((((.((......)).))))((((,.((((....)))))))){(((((((((.{{........,.||,........,}}}.......,|,.(((((((((((({,.,,,,||,......|||||.|||||...(((((.(((......))).)))))..,|||||,,,,...((((((((.......))))))))}}}}||{{{{((((.....))})).)}}},,,,......,,,.,.}))))))))))...{((((((((.(.....).)))))))))..........{((((......))))}.....(((((((((,..(((((((((((((((((((.(((({.(((((((.(..((((.((((({.............,{.{((((....({(((.((({......}})}.))),)}})))},,,{{{..(((((.((({...................(((((.....)))))...........,((((......))))|(((((((((.............))))))))),(((((((((({...{{((({(..(({..(((((.........)))))..}))....)))))))))))))))))).....,.......)))).)))))..)}||.((((((((((((..,,,........,},)).)))))))))).......((((((((((((((((((,{.,,,....((((((.((((.{((,(({{(((((..((((.{(((((......)))))).))))...))))))},.))).....(((((......)))))...)))))))))),,,.,,...))).)))))))))))))))...(((((((.(.(((((....))))).).))))))).....((((((.((....}).))))))))))))..))))..).)).)))))............)))))))))))))...........,,.........{{{({.....)))),)))))..)))))).....)))}}}))))............))))))))))...(((((((((...))))))..)))....{{{|,.....)}}}.||}}}}}}}}}.(((((((({...})))))))).....,...,.},,))))}....,}}},,,....})}}))))))))))))}.....))))))}.)).((((..|....},.))))....|{||...,..,,,.,}}},)))))...)))))).....)))
Forensic Context

No forensic context available.