Basic Information

Symbol
hsa_SATB2_0007400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0057690 hsa_circSATB2_036 hsa-SATB2_0005
Host gene
SATB2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:200213424-200246543 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:199348701-199381820 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-204.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -220.26 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 251.40
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........((((((((.(.(((..((((((.(..((((....(.((((...(((...((.(((((((.(((..(((((........)))))..)))))))))).)).......((((((((((....)))....))))))).((((.(((((.(((...(((((....(((........))).........((((((((((......((((..((((((((((.(((.......(((((...(((((((((.(.((((((((.....)).)))).((((((.........))))))..(((......)))))..).))))))))).)))))........................(((((.((...........)))))))...))).))))))))))((((((........(((.........))).....))))))....(((((((........((.(((....((((.................(((((..............)))))..((......))......))))..))).)).......)))))))...................(((........)))..(((..(((((.........))))).)))((.((((((...)))))).))..((........))))))....))))))))))......)))))...))).))).)))))).....((((........))))...(((((.((((....)))).)))))..))).)))).)..))))..).))))))))).)...)))).))))............(((((........)).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,........((((((((.{.(((..((((((.|..{(((,,,.{,(({{...{{{,..((,(((((({,(((..(((((........)))))..)))))))))}.))|||....{{((((({{,..,,})),...}}})))).(({{{((,(({(((.,.((((,....,,|}}}.,}}})))..,,.....{(((((((((,...{.((((..,,{(((({((.{(({{.....(((((...(((((((((.,.{{,,,,{{....,||....,.({((((,,,.....,))))))..{{{......))}||,,}.))))))))).)))))......{{{{{{.........{{{((,,({(({{...{{{{,,,,},,}|,{,|||.||||}}}|||(({{((,,....,,|,{.........,}}.....)))|||.....((((((.............|,.)))}}}..},,............{{{{{..............}}}}}..{{,.....}}......,)}}}.}))}}|}|,}}},)).))}}}}}..}}}}}.,}}}}},.(((........))){((((..(((((.........))))).))))}.,,,,||||.}))))),....{|........}},,}}....))}}}))))),.....,,,,,...}},.}}),))}))}..|}.{{{|,.......)))}...(((((.((((....)))).)))))..))),))),.,..)))),,),))))))))).,...)))),,))),,..,},,....(((({........)).)))..
Forensic Context

No forensic context available.