Basic Information

Symbol
hsa_SATB2_0009600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0118571 hsa_circSATB2_020 hsa-SATB2_0049
Host gene
SATB2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:200233328-200298202 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:199368605-199433479 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-128.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -139.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 140.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.(((.((((((.............))).))).).)))))).((((((((.((((((...((((((((((...(((((..((((.......)))).)))))..(((((((((.(((((.((.((.(((....))))).))........(((((((..((.(((......)))))))))))).)))))..))))).)))).(((((((.(((..(((((........)))))..))))))))))..((((......))))....(((((.((((....)))).)))))((.((((((.(.((((.......)))).)))))))..))......((.....(((...))).....))))))))))))..)).....(((((...(((((((((.(.((((((((.....)).)))).((((((.........))))))..(((......)))))..).))))))))).))))).....)))).))..)).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.(({.((((((,...........,)))},)}.}.)))))).((((((({.((((((...{(((((((({.,.{((((,,((((.{..{|{||||{||||},{(((({({{{,,{{{.,,,,{|.{{|,},,)})},,))}.......(((((((..((.(((......)))))))))))).,))),,,},},)})}|{.(((((((,(((..(((((........)))))..)))))))))).}}{{{....,,||{|{.,.,||||}||||.,}})))}.}}}}}|,.((((({.{.((((.......)))).}))))))..,|{{...,|}...,,{((...},}......,}))))))))}..)).....(((((...(((((((((.{.{{,,,,{{....,||.,,,,.((((((,,,.....,))))))..{{{......))},,,,).))))))))).))))).....)))).}}..)),}))).
Forensic Context

No forensic context available.