Basic Information

Symbol
hsa_RP11-486F17.1_0000300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SATB2_0146
Host gene
SATB2
Type of circRNA
Exon-Intergenic
Location (GRCh37)
2:200193585-200213765 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:199328862-199349042 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-136.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -144.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 74.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..((((..(((((......)))))..))))..)(.(((((..((((((..(((.(((......))))))((((.......((((((((..(((((((((((((((((((.((((........((((((((...((((((.(..(.(((((...(((((.(((((((....)).))))))))))...).)))).)..)..))))))..)))))))).)))))).))))))..((((((((((((((((((.....))))..)))..)))))))))))..)))))..(((........))).....)).))))..))))))))......))))((((((((((((.......((......)))))).)))))))).))))))..)).))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..((((..(((((......)))))..))))..)(.(((((..((((((..(((.(((......))))))((((.{.....((((((((..(((({((((((((((((((.((((........{{{(((((.,.((((((.,..(,(((((...((((({(((((((....))}|}))})))))...}.}}}),),,,..)))))}..)))))))),))))))}})))))..(((((((((((({(((((.....))))..})).})))))))))))..))))),.(((........))).....}},})))..))))))))}.}}}}..||((((((((((((.......{{......)})))).)))))))),))))))..)).))).)
Forensic Context

No forensic context available.