Basic Information

Symbol
hsa_chr2_0409700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SATB2_0112
Host gene
SATB2
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
2:200162899-200163763 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:199298176-199299040 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-177.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -199.23 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 259.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.............)))(..(((((..........(((((.((((......)))).)))))......((((((((.................(((((.........((((((((((((((((..((.((..(((((.(((((....((((.(((..((....(((((........................)))))....))..)))))))...)))..(((((((((((((((((((.((.((((..(((((((....(((..((.(((((.......(((((((((((((......))).))))))))))(((((((((((.(((...............)))))))))).)))).......))))).))..)))....)))))))...)))).))..))))))))................))))))))))))).)))))..))..))..))))))))))(((((...)))))...(((((....(((((((.(((((............(((((..(.(((.((.......)).))))..)))))...((..(((.........)))..))..)))))..)))))))))))).......((((...(((((((..((((.(((((.(((.......(((((((((((((((((...((.(.((.((.((.((((.(........).)))).))..)))))))..))))))....))))))))))))))))))).)))))))))))...))))......((((.(.....).)))).)))))).......)))))))))))))...........(((....)))......(((((....))))).......)))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((,{.,{,,..,,...{(((((,,........(((((.((((......)))).)))))...{{..{((.((((((.{.{{{{,.....,,(((({{{{.{{{|{((((,{(((((((((..{{.((,,(((((.((,...{{{(,,.}|||,{(({,..,,|||}},..............,,,....}|},|{{,.,,,}))}})},..,)}}}.{((((((((((,,,,({(({(({(((({{({{,(((,..,((({{(({((.....,}},,|{(((((((({{{......}}}.))))))))|((((((((((((.{{,....,,,.....,..})}))))))).))))),.{{{{|...{{{...,,)}}..,)))))),,,))))})}..))))))))})),...})}......))))))))))))).})))).,)}..},..)))))))))))))}}...,||,.......................|,.............},,...}))}.))))).)))||{||},,....,,}}}}}}}.}.)))})).}))}}.(({......}}),})},|||,}}}}}}....{{(((,..,(((|((({.,{||,|{{||}|{|,,,}...(((((((((((((((((...((.{.((.{{.((.((((.{........}.)))).))..}}))}))..))))))....)))))))))))})))}))),)))})|},|||...}})},.,||.||||.,.,{{|,.....}}}|||||||.....|||||,.{,{,,,.....,,,..||}}}..}}}......|||{|....))))).,.....,}}}),..)
Forensic Context

No forensic context available.