Basic Information

Symbol
hsa_SATB2_0006000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SATB2_0162
Host gene
SATB2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
2:200188569-200193606 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:199323846-199328883 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-511.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -544.97 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 290.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((..((.(((.....))).))..)))))).....((((...((((.......(((((((..(((((.((.(((((..(((....)))..(((((((((......))).))))))(((......)))......(((((((((..((((((.((((((..............((((((...(((.....)))((((........((((((((..(((((((((((((((((.(((((....(((((.(((..((((((((..........).))))))).))))))))...))))))))))((((((((((.((((.......(((((((((((..(((((((((((...))))))...........(((((....))))).(((....)))......(((....)))..........((((((.(((.((.....)))))...))))))...((((........((((((((((...))))))))))........)))))))))..))))))))))).....(((((((.(((((((......))))........(((((.(((....))))))))..))).)))))))....((((.....))))((((.((.......))))))......((((((((((((.(((...))).)).))))).)))))..)))).))))))))))((((((....))))))....((..(((((....(((((.((((.((((((((((..((((...............))))(((...)))......((((((.((((((((((....((((.......))))....))))).))).(((((..((.(((.....))).)).)))))........))))))))....)))))))))))))).)))))......)))))..))((((...(((((.....)))))))))......((((((...))))))..((((((....)))))))))))).))))))...)))))))))))))))))).(((((((.((((((((((((((.(((((((((((((....((((...(((.(((.......((((((.((((((((.....(((((((..((((((......((((((((((...))))))))))((((((((((......))))))).))).....))))))..)))))))..((..(((((((....)))).)))..))((((((......(((..((((...((((((((((..(((..((((((.........((((((((((...))))))))))......)).))))))).)))))))))).....))))..)))....))))))...)))))))).)))))).......))).)))..))))))))))))))))))))))))))..))))).))))))).........((((((((.(((..(((((((...(((((.((((((..(((.(.......).)))....)))))).)))))....(((((.(((....)))))))).(((((((((((..(((((.........))))).)))))))(((((.....))))).....(((((.((((......)))).)))))...(((((.........)))))))))..)))))))((((((....)))).))...................((((((......))))))...))).))))))))........)))))).....((((.....))))..))))))..))).))))))))))).)).).)))).....)))))))......)))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((..((.(((.....))).))..)))))).....((((...((((.......(((((((..(((({.((.,((((|.(((....)))..(((((((((......)))}})))))(((......)))......(((((((((..((((((.((((((......,,{{{{...{{{.({{{,,,.....)))}},)))......|{((((((..(((((((((((((((((.(((((....(((({((((..((((((({.,,.....,,).))))))).))))))))...)))))))))),(((((((((.((({.......(((((((((((..(((((((((((...))))))...........{{{{...,,||}}|.(({....})}.,,.,,||{,...|}...,}}}....((((((.(((.((.....)))))...))))))...((((........((((((((((...))))))))))........))))}))))..)))))))))))....{(((((((.(((((((......}}})...,,...(((((((((....))))))))..))).)))))))}...((({.....}}}}{(((,({....,},}}))))......((((((((((((.(({...})).)).))))).)))))..}))).))))))))),((((((....))))))...{((.{((((({|{,(((((.((((.((((((((((..((((...............))))(((...)))......((((((.({((((((((.{,.((((.......)))),,..))))).))).(((((..((.(((.....))).)).))))){,....,}}}))))))....)))))))))))))).)))))..,{{{|||,|{{,,((((.{(,,,,,.},.})))))))))}}},,,||||||,,,)))}}}..((((((....)))))))))))).))))))...)))))))}|||||{((((.{((((((.((((((((((((((.(((((((((((((....((((...(((.(((.......((((((.((((((((.....(((((((..((((((......((((((((((...)))))))))){{((((((((......))))))))})).....))))))..)))))))..{{..{{(((((....)))).}}}..}},...||...,,}|....,,,,...{(((((((((,{{{...((((((.,,.{(,,,({{((((({,..,)))))))))).}..,.)).))))})).)))))))))}...,{||||,.,.,,.,,}},}))},.)))))))).)))))).......))).)))..))))))))))))))))))))))))))},,}))).))))))}.)))))}}}|{((((((.(((..(((((((...(((((.((((((..(((.{.....,.}.}})},..}))))).)))))....(((((.(((....)))))))).{(({((((((((.(((((.........))))).)))))))(((((.....))))).,{.{(((((.((((......)))).))))},}.||,{,.....||...,,}}}))}..))))))){{((((....)))).},...................((((((......))))))...))).)))))))}........)))))).....((((.....))))..))))))..))).)))))))))),.)).}.}))).....)))))))......)))).))))
Forensic Context

No forensic context available.