Basic Information

Symbol
hsa_SATB2_0007000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SATB2_0135
Host gene
SATB2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:200211385-200212496 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:199346662-199347773 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-279.04 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -301.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 230.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.((((.(((((((.....(((((.(.((((.(....(((((...........)))))....).)))).).)))))......(((((((((.....)))))))))........(((((((..((((..............((........)).((((((.((((...((..(((.....)))..))..)))).))))))..................))))..)).))))).........)))))))..)))).)))))((((((.(((..(((((((((...((((.........((..((....)).)).........))))...)))))))))...)))(((((..(......)..))))).......(((((((..........(((..........(((((((((((.......(((((....)))))(((.(((..((((((((.(((((.((.((...(((((...((((.((......)).).)))...)))))..)))).))))).)))))))).))).)))......(((..(((((((((...(((....))))))))))))...)))....)))))))))))(((((((((((((((..((....)))))).).)))))).)))).((((((((((((((((((((((((((..(((((((((((((.((((((.(((...(((((((.....)))))))...)))......................(((((((((..(((.......)))....))).))))))(((((....))))).((((....(((((..........((((((((..(((((((.((.........))))))))))))).)))).(((((((((...(((...................................)))....))))))))))))))....))))......))))))...))))))).)))))).))))).....(((....((((.(((...(((((((((((((.....))).))))))))))..........))).))))......)))))))))))))).))))))))))..))))))))))......)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((.{(((.(((((((....{{{,..,{,{{{{,,.,,.((((,.,,..,.{.,,|,,|,{{(,,..(((((((({((,{{...(((((((((.....)))))))))....,,...)))}},.,)))))))....}}}....,.......}|}}.((((((.((((...((..(((.....)))..))..)))).))))))..............,..,,.}},.,)})}},},,...,..,))))))}..)))}.))))}((((((.,({..(((((((((...((((......,..((..{,....}}.)).........))))...)))))))))...|||(((({..,.....,),,)}}}}.......(((((((..........,,{..........{((((((((({.......(((((....)))))(((.(((..{(((((((.(((((.((.,,...(((((...((((.((......)).).)))...)))))..}})).))))).)))))))).))).)))......{{{.,(((((((((,..{{{....))))))))))))...})}....})))))))))}((({(((((((((({.,((....)))))).),)))))).)))},((((((((((((((((((((((((((..(((((((((((((.(((((({((((..(((((((.....))))))),..||,....,,................,,|{,((((({(,.....)}))))},,.(((((((((.,....,.))))))))),,,....,,,||},..}}))),((((((((..(((((((.((.........))))))))))))).)))).(((((((((...(({..,.,,.........................,...}))....))))))))).}|||....))).......})))))...))))))).)))))).))))).....{{{......,,,{(....}||,{{{{,,,.((((.{.((((((({...)))))))).}.)))).}}}}.,,...}}})))))))))))))))))))))).,}}})))))))......)))))).
Forensic Context

No forensic context available.