Basic Information

Symbol
hsa_SATB2_0008200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SATB2_0094
Host gene
SATB2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
2:200213424-200246577 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:199348701-199381854 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-214.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -229.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 243.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((.....(((((.(((((..(((((.((((.......((((((((.((.(((......))))).))..((((((...(((((((...((((((((((((((......)))))....))))........((((..((((......))))))))(((((.((((....)))).)))))...((((((.(.((((.......)))).)))))))...(((...))).....(((...))).((..((((((((((.(((.......(((((...(((((((((.(.((((((((.....)).)))).((((((.........))))))..(((......)))))..).))))))))).)))))........................(((((.((...........)))))))...))).))))))))))..)))))))...))))))).....)))))).))))))(((.((..(((......)))..))...))))))))))))..............(((((..............)))))..(((..(((((.........((.(((((((((((......(((((((.((....((((((..(((........)))(((((..(((((.........))))).))))).....(((((.(((((.....((........))........(((.((((.((.................)))))).))).)))))))))).............(((((.((((....)))).)))))..))))))....)))))))))))))))))))).)).......)))))...)))))))).)))))......)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((.....(((((.(((({..{{(((,({{{.......(((((((,.((.(((......)))})}))}}||.{{{{...,,||||,.,({((({(({,(((,.(((((........)))))..})))}))))}.}}|||....,{{{{{{||,.,|{|}|{{,.,}})))).|||||{{.((((((.{.((((.......)))).}))))))..,{{{...|||{{{{{{({...},|,{{..{(((((((((.(((.,.....(((((...(((((((((.{.{{,,,,{{....,||.,..,.((((((,,,.....,))))))..{{{......))},,,,}.))))))))).)))))......,,,............,,,(((((.((...........})))))).|.))).)))))))))){{||||}},...}}|||,,.....,,}}}..,,,)))|||.,,..(((,,,...}}}..,,...}}.)))))},})..............(((((..............}))))..(({..{((((.......|,{{.(((((((((({......{(((({{.{{,...{(((({..(((........))){((((..(((((.........))))).))))}.....((((,{(((({.....((........))........|||.{{||||{.................}})))).))}.})))))))))......,......(((((.((((....)))).)))))..))))))....}})))))))))))))))))).)}.}}....)))))...)))})))).)))))......))))),,.
Forensic Context

No forensic context available.