Basic Information

Symbol
hsa_chr2_0410600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SATB2_0093
Host gene
SATB2
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
2:200230241-200230890 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:199365518-199366167 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-125.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -137.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 121.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((......)).))))..((((((((........(((......)))...............(((((.....(((((.....(((((((((((..((((((((((...........((((((..((((..(((((......((........))......)))))..)))).)))))).....((.....(((((.(((((....)))))...))))).....))...))))))))))...)))))).....)))))......))))).....))))))))))).))((((((((((((((................((((((((....))))))))..(((.....(((((((((((.(((((((((((((((((((...........((((((.......(((((((...((((...)))).))))))).......)))))).(((((......)))))...(((((((.(((.((.((((((((((((...))))))).....(((((((..((((..((((........))))..)))).)))).)))))))).)).)))..)))).)))....)))))))))..(((....))).))))))))))...))))).))))))...)))))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,..{{,,..,,,{{{|,{|{{{,.,,((({{.,.......|||..,},.))..,}},..........(((((.....(((((...,,(((((((((((..((((((((((..,,,......{(((((,.((((..(((((......{{........))......}))))..)))).})))))..,,.||,....(((((,(((({....))))).,.)))))..........))))))))))...))))),....})))))..,}..))))).....))))).,,,)).,}|(((((((((((((,,,...,,||.,,{..((((((((....)))))))).,|.|,,,..{((((((((((.(((((((((((((((((({..,,,,,,,,.((((((.......(((((((...((((...)))).))))))).......)))))).(((((......)))))...{{(((((.(((.((.((((((((((({...})))))).....,{{{{{{..((((..((((........))))..)))).}}}}.)},))))).)).)))..)))).))),,.,)))))))))..{{{....,},.))))))))))...))))),})))))...,,,))))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.