Basic Information

Symbol
hsa_SATB2_0012800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SATB2_0130
Host gene
SATB2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:200261666-200263221 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:199396943-199398498 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-250.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -269.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 251.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.....((((.(((((..........((((.(((((((((((((.....(((((((......(((((.((.(((....))).)).)))))......((((((((((..................)))).)))))).((((((((((((((((.......(((((.....((...........))......)))))...........)))))))))).....)))))).))))))))))))))))).....(((....)))))).)))).))))).))))....))))(((......((((.......(((((((....)))))))....(((((.(.(((((((.((((((((((((((......))))))...))))))))((((......((((((((......)))))))).......))))..........((((..(((((((((..(((.((..(((((((((((((((((....))))).....))))))..))))))..)))))..................((((((...(((((((((((..(((......)))....(((((...)))))....((((((((.((((((...................)))))).....)))))))).(((((..(((.....))).)))))((((......))))((((.((......((((...)))).......))...))))..(((((....))))).............((((((((.....((.((((.........)))).))............)))))))).((((.((....)).)))).))))))))))).)))))).(((.(((((......))))).....(((((((....)))))))..)))......................((.......)).....((((((...((((((..((.((((.((...)).)))).)).....))))))...)))))))))))))))....))))..))))))).).)))))..)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.....((((.(((((.........,((((.(((((((({(((({..{{{((({{,..{(.,((({,.,,,}|},...}),,,}.)))))}}}))}}|||,,,|||}}}}}},...........,,,,.,|||||,((((({({{{{(((((,,.{,{.{{(({.,,,,((......,,...}}......)))))....,,.,...,}}}}}))))....,))))}},))))),,.}))))))})}}}.{{{{....))))......}.))))).))))....})))(({.,,,,,,......,}..(((((({....})))))).,,,{{,,.,.|||||},..{{{{{{{|||{{{|,..,,{||,}||{,{|}||}}}}},,.......((((((((......))))))))......,(({...........,.,|,,{{{{{,{{,..{((.((..(((((((((((((((((....))))}....,)))))}.,))))))..))))}..................((((((...(((((((((((..(((......)))....(((({...}))))....((((((((.{(((((.....,......,...,..})}})),....)))))))).,{{{{..(((.....})).||||,((((......))))||||.{{{.....((({...}))).....,}},}|,||}|,.(((((....))))).............((((((((.{,..((.((((.........)))).)).........,..)))))))).((((.((....)).)))).))))))))))).)))))).({{.(((((......))))).....(((((((....)))))))..|||...{{{{{{...{{{{,.....((,.....,||{{...((((((...((((((,.((.((((.({...}).)))).)).,...})))))...))))))))))))})),..,})))}}))}}...,},))})))})))})))
Forensic Context

No forensic context available.