Basic Information
Symbol
hsa_SATB2_0013200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SATB2_0052
Host gene
SATB2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
2:200262253-200263221
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
2:199397530-199398498
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-228.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-246.42 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
213.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((.....((((.(((((..........((((.(((((((((((((.....(((((((......(((((.((.(((....))).)).)))))......((((((((((..................)))).)))))).((((((((((((((((.......(((((.....((...........))......)))))...........)))))))))).....)))))).))))))))))))))))).....(((....)))))).)))).))))).))))...)).)(((((((.((((((((((((.(((((((....)))))))((((((......)))))).(((((((((((((((......))))))...))))))))).........((((((((......))))))))....(((((((.................((((......((.....)).......)))).((((....))))))))))).((((((.((((((........................((((((...(((((((((((..(((......)))....(((((...)))))....((((((((.((((((...................)))))).....)))))))).(((((..(((.....))).)))))((((......))))((((.((......((((...)))).......))...))))..(((((....))))).............((((((((.....((.((((.........)))).))............)))))))).((((.((....)).)))).))))))))))).)))))).(((.(((((......))))).....(((((((....)))))))..)))...)))))).))))))......((.......))............))))))........)))))).)).))...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((.....((((.(((((.........,((((.(((((((({((((,..{,{((({{,..{{.,((({,.{,,}||,...})},,}.)))))}}}})}|||{,,,|||}}}}}},...........,,,,.}|||||,((((({{{{{{(((((,,.{,{,{((({.,,,,((....,.,,...}}......)))))....,,.....,}}}}}))))....,))))}},)))))},,})))))))))}}.{(((....))))......}.))))).))))...)).)(((((((.((((((,...,..(((((({....})))))),{{{((.,.,.,|||}},..(({(((((((({{,.....,}}}))),..})}}))))}.,.,,,..,((((((((......))))))))....{(((((,.................,,,,......{{......,.......||||{((((....)))))}))))).{(((((.((((({.|,.....................((((((...(((((((((((..(((......)))....(((({...}))))....((((((((.{(((((.....,......,...,..})}})),....)))))))).,{{{{..(((.....})).||||,((((......))))||||.{{{.....((({...}))).....,}},}|,||}|,.(((((....))))).............((((((((.{,..((.((((.........)))).)).........,..)))))))).((((.((....)).)))).))))))))))).)))))).(((.(((((......))))).....(((((((....)))))))..)))...}))))).)))))}.........,,..{(((((.............))))))..,,,)))))).)).))...)))
Forensic Context
No forensic context available.