Basic Information

Symbol
hsa_SCAPER_0016400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0104592 hsa_circSCAPER_017 hsa-SCAPER_0007
Host gene
SCAPER
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
15:77020936-77059429 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
15:76728595-76767088 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-209.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -225.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 134.29
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((....((((((((..........((.(((((((.((.(((.......((((..((((((((.(((.(((.((((..(((((.((((((((((((...............))))).......(((((.......)))))..((((.......))))..)))))))..)))))..)))).))).)))))))).)))..))))...(((((...(((((.(..(.(((((((((....(((((((.(((..((((.(((...........((((((((......((((.........))))....))))))))(((((.......))))).........((((((((...(((.((((........))))))).(((....)))....))))))))..........(((......))).............))).)))).....)))...)))))))....)))).....))))).)..)...)))))..))))).))).)).))))))).)).......(((.((((.(..(......)..).)))).)))(((((...(.....((((..((((((....)))))).....)))).....)...)))))(((((((......)))))))..........((((.(((.((...(((.(.((.(.(((((((.(((....))).))))))).)...)).).))).)).))).))))......(((......)))..............(((((...((..(((.(((......((......)).......))).)))..))....))))).......(((((..(........)..)))))...((((.............).))).......((......)).))))))))...)))..))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..(((....((((((((..........((.(((((((.((.(((.......((((..(((((((,{(((.(((.((((..(((((.(((((({(((((...............))))).......(((((.......)))))..((((.......))))..}))))))..)))))..)))).))).))))))))))))..))))...(((((...(((((.(..(.(((((((((.{,.(((((((((((..((((.{(({..........((((((((......((((.........))))....))))))))(((((.......))))).........(((((((,...(((.((((........))))))).{{{..,,)))....}}}}}},,..........(((......))).........,,..})),,,)),,...)),,),}))))))..}.)))).....))))).)..}...)))))..))))).))).)).))))))).))...(((.(((.((((.(..{......},.).)))).))).|||...,|.....((((..((((((....)))))).....))))..........,}}}(((((((......))))))).........,((((.(((.((...{{{.(.((.(.(((((((.(((....))).))))))).}...)).).}}}.)).))).))))....}}(((......)))...........,..(((((.,.((..(((.(((..,,..((......)),,,....))).)))..))..,.))))).......{((((..{.....,,....,,,,....,|||...,,...,,,..}.|||.......,,.....})),))))))))...)))..))).........
Forensic Context

No forensic context available.