Basic Information
Symbol
hsa_SCMH1_0003200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0011938
hsa_circSCMH1_024
hsa-SCMH1_0002
Host gene
SCMH1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:41512079-41541123
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:41046407-41075451
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-208.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-220.95 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
135.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((....)))).......((((....(((((.....((....))....)))))....))))........((((((((((..........((((((((((((.........(((((..((.((....((....))....))))..)))))...))).)))))))))..))))))))))......(((((.......))))).....((((.....))))((.(((..(((((....((((((...(((((((((((((((.((((..........(((((.(((((....((.(((.......))).))))))))))))...........(((.((((.(((((((((...(((((((((.......((((((...((((..((((.(((.....(((....))).....(((((((................))))))).))).))))..))))..)))).)))))))))))...))))))))).).))).))).......(((......)))...((((....)))).))))...))))))).)))....)))))...))))))..((((.................)))).((........))..........))))).))).))(((....((((((...((......(((((((((((((((..(((.....)))......))))).....)))))))).))))...))))))....)))....)))))(.(((....))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((....)))),......((((,...{{((({.,,.(({...,,..}})}))},,},})}}........((((((((((..........((((((((((((.,.......(((((..,,.(((,..((....))..,.))))..)))))..,))).}))))))))..)))))))))),|,...(((((.......)))))....,((((.....}))}|||||...((((...}}}}{({{...(((((((((((((((.((((..........(((((.(((((....((.(((.......))).))))))))))))...........(((.((((.(((((((((...(((((((((.,,..,,{{,{{{,,.,{((,,(({{.(((..,..{{{....}}}.,}..(((((((.........,,.....})))))).}}}.}})),.}}}}.,)))}}},)))))))))...))))))))).).))).))).......,({......,,}...((((....)))).))))...))))))).)))....))))).{{|||{({{.((((.................)))).|..}})},..)),........}},|{{{{.....|))}}..{{{|||,,.........({(((((((((((((..(((.....)))......))))).....)))))))).})}}...,}))))...{|....)})))))(.(((....))).)
Forensic Context
No forensic context available.