Basic Information

Symbol
hsa_SCMH1_0009200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0011946 hsa_circSCMH1_013 hsa-SCMH1_0037
Host gene
SCMH1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:41578955-41618413 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:41113283-41152741 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-259.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -276.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 279.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...)))((((..(((((((((....)))))..))))...........((((((..(((((((((((((((........))))))))...)))).))).))))))((((((.((.(((((((((((...((((.((...((((((((((..(((((((........................)))))))..(((((((..((((((................(((........)))..(((..(((...)))..)))))))))..))))...)))...........(((((((....((((....).)))....)))))))...((....)).(((.(((....))).)))......))))))))))..)).))))...))..((((((((((((((.((....))...((......))...((((((..((....)).))))))))))))))))))))..((((((((..((........))....))))))))...))))))))).)).)).))))..((((..((((((((((((((.((((..((((..(((((.(((((.....((....))......))))).)))))(((((((((...(((............(((......)))(((((..(((((((((((((((.((((((((((.....))))))))))..))))))))...........)))))))))))))))...)))).)))))))))))))))))))))..))))))...))))..(((....)))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...)))(((,..(((((((((....)))))..)))).(((((....{((((((..(({((((((((((((........))))))))...)))).})).))))))|((((({((,(((((((({,,,||||{{.{{...{||||......,{((((((....,..............},,..))))))|,|{((((({,{{((({,.|||,{({{,......{((,{{.{,,,||}{{,,,..||.,,.})}..))))).},,,|}))).,||((,...,,...,,|{{((((....{{{|,,..)}})),,,,))))))||..((,..,||,,||,|{{....))).)))..........,}..,...))}}|||||..,..((((((((((((((,((....)),..,,......,,...((((((..((....)),})))})))))))))))))))..{{{(((((,,(|......,,||,,,,|||||}}}...,}||||},|,|,{||{|||,...,(({.,,|||,,,,||||}}|,|.,,||||||{{{,,.{,|||}|},,..}}}}}},..}}}}))))}}))))|||||,,{{,,,|||.,,,,.....{|||||,.....,)))|||}}||||||}((((((((.((((((((((.....)))))))))),.))))))))....,{{{{{{|,||||...,,)))},,,||,,|||,}})))}}))}))}|},}}..})))},,..}}},,,|||....)))}}}))))
Forensic Context

No forensic context available.