Basic Information

Symbol
hsa_SCMH1_0009400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0003751 hsa_circSCMH1_007 hsa-SCMH1_0019
Host gene
SCMH1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:41578955-41627104 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:41113283-41161432 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-337.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -358.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 183.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...(((((...((.((((....))))))....))))).....((((((.((((((((((...(((((.(((((((((.((((....((((((((((...((((((((....(((.....((((((....))))))......)))...))).)))))))))))))))))))....((((...)))).....))))))))).......((((((......))))))...((..((.((((((...(((........)))...)))))).))..))......(((((((((((......(((((((...((((.....))))(((((....)))))..))))))).......(((((((..(((((((((((((((........))))))))...)))).))).))))))).(((((....(((((((...))))).)).....))))).......(((((((........................)))))))..(((((((((.(((((.(((.(((((.......(((((.((((((........)).)).))...))))).....))))).(((((((.((((....(((((((....((((....).)))....))))))).(.(((.((((((((.(((....))).)))..................)))))..))).)..((((((((((((((.((....))...((......))...((((((..((....)).)))))))))))))))))))).)).)).)))))))..(((.(((((((((((((........((((..(((.(((((((.....(((...)))....))))))).).))..))))........))))))))).)))))))..))).))))).)))))))))........)))))))))))((((((((.(.((.((((((((((((((.((.((((((((((((((((.....))))))))))(.(((..........))).))))))))).))))))...)))))))).))))))))).))..))))).))).)).....))))).)).))))))(....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.,,({(((,.,((,((((....,}}}},....,}))),,,},||{(((.((((((((((...(((((.((((((((((((((,...{(((((((((.,{((,{,{{{....(((.....((((((....))))))......)))...}}}.)))),)))))))))))))}....,{({...}))}..,),})))))))).......((((((......))))))...(({{({.((((((...(((,,....,.)))...)))))).}}..))))}...(((((((((((......(((((((...((((.....))))(((((....)))))..))))))).......(((((((..(((((((((((((((........))))))))...)))).))).))))))).(((((....{((((({...})))),}}.....)))))......,(((((((..,.,..............}},..))))))).,(((((((((.(((((.(((.(((((.......(((((.{{{({{........}}.)).))...))))).}...))))).(((((({.{{,.....(((((((....((({....},}))....))))))).{.(((.,{((({((.(((....))).))}...........,......))))),.))}.|..((((((((((((((.((,...)),..{{......}}...((((((..({....)).}))))))))))))))))))).,|.)),}}))}))..{,{,(((((((((((((.,......(((({.(({.(((((((.....(((...)))....))))))).,.)),,,}))}.....,.)))))))),.)))))),..))).))))).)))))))))........)))))))))))((((((((.{.{,.((((((((((((((.((,(((((,((((((((((.....)))))))))){.|||,,,,,.....)}}.}})))}))}.))))))...}))))))).}}))))))).)}..))))).))).)).....))))).))},}),)}{....)
Forensic Context

No forensic context available.