Basic Information

Symbol
hsa_SCMH1_0009600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0011948 hsa_circSCMH1_002
Host gene
SCMH1
Type of circRNA
Exon-Intergenic
Location (GRCh37)
1:41578955-41707815 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:41113283-41242143 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-363.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -384.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 347.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((((((((...((((((((((........((((((....(((((((((((...((((.......))))...((((..(((((((((((((((.......(((((((.....)))))))......))))(((.....)))((((....))))...((((((.(((((((((((((....(((((....))))).(((((......(((((...(((...(((((.(((...........((((.....))))...))))))))))).)))))....))))).......)))).)))))))..)).)))))).........))))))((((((....)))))).........(((((((.(((((.......))))).)))).))))))))..))))....)))))).))))).((((((......))))))...((..((.((((((...(((........)))...)))))).))..))......((((((..((........))..))))))...(((((((........................)))))))..(((((((..((((((................(((........)))..(((..(((...)))..)))))))))..))))...)))...........(((((((....((((....).)))....))))))))))))))))).))))))...)).))))))).................(((.((((((.....((((((((((((((.((....))...((......))...((((((..((....)).))))))))))))))))))))..((((((((..((........))....))))))))(((((((((..(((.(((((((.....(((...)))....)))))))......(((..(((((.(((((.....((....))......))))).)))))..))).......))).))))))))).)))))).)))...(((((..(((((((((((((((.((((((((((.....))))))))))..))))))))...........))))))))))))))))).........)))))((((((((....(.(((.((.....)).))).)....))))))..))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((({{,,(((((((((...((((((((((......,,((((((....(((((((((((..,((((....,,,)))}.{,{,,,.,|||..,{{{,{{{{(.......(((((((.....)))))))......}}}}{((,...,}}}((((....))))...((((((.(((((((((((((....(((((....))))).(((((.,....(((((,..(((..,(((({{({{.....,...,,,{|}..,}})),,..,)))))))}}}}.)))))....))))).......)))).)))))))..)).)))))).......{{|},,,,((((((....)))))}......|||,{{{{,..,..,,...||}}|||{,,||,,,|},}}|}}||||}}|||.)))))}.}}}}}.((((((......))))))...{{,,{{.((((((...({({{...,,.)))...)))))).}),,)},)),..||||||||{{...,.,,.||,,}}}}}}...(((((((..,.,..............}},..))))))).}{{{((({,,(((({,.}}},|{,.,.....,|||,,,,,...|}}||,,{..{{,,,.}))..))))),}}}..)))}..,,||....,,.....(((((((....((({....},}))....))))))))))))))))),})))))...)).))))))).................{(({((((((....,(((({{((({{((||{{....||{...,,,,,...,,,{((((((..((..,,||{,||,,,,))}}}}})))))}..|||((((({{(,.{{{{,{((({{(((((({.|......((((,.(({.(((((((.....(((...)))....))))))).,.)),|||}}|,,.,.|.})))))}},.}))}))..{{{{,,,))}))))).})))}}},,}})))}))))}),,,})))))).,,,..|((((({{(((((({((((((((.((((((((((.....))))))))))|.}))))))}.....,,,.,,)))))))}))))))},,.,,}}}}}.)))))((((((({....{.(((.((.....)).))).}....)))))),.,)
Forensic Context

No forensic context available.