Basic Information
Symbol
hsa_chr1_0869700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SCMH1_0053
Host gene
SCMH1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
1:41493760-41503116
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:41028088-41037444
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-196.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-206.40 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
126.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((.((((.((((((...(((((((((((....))))..(((((......))))).......((.(((((((...((((.((.(((((........(((.........)))......))))))).))))))))))).)).((......))..))))))))))))).(((((((.................((((((....)).))))(((...)))...((((((((....))))....)))).)))))))(((((((((((...)))))))...)))).............((((((........))))))))))))).))))))(...((.((((((((((((..((((((((..(((...))).)))))))).))..............(((....)))..(((((((((((.....((((.......(((((.(.((((((.((((..((...))..)))).)))))).).))))).....)))))))))).))))).)))))))))).)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.((,{((((..,{.(((((((((((.((((....))))..(((((......))))).{{{{{(,,((((((.,,{(({,{.||||(({({{(((((((.{.((....{{(,({.((....)).)).))))}}),)))))))),.{(((((((((((.........))))..}))))}}},.......|,..(((({{....)),)))))}}}}.}}},,,||,,((((....))))...,)),)))))))))),,,(((((((...)))))))}}})),,.....))))).,,((((((........)))))))))))}),))))))(...((.((((((((({{({,((((((((..(((...))).)))))))|,|,,....|,,,,....,||,...,,...{((((((((((.....((((.......(((((.(.((((((.((((..((...))..)))).)))))).).))))).....)))))))))).)))))))))))))))).)).)
Forensic Context
No forensic context available.