Basic Information

Symbol
hsa_SCMH1_0001600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SCMH1_0149
Host gene
SCMH1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:41499655-41627104 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:41033983-41161432 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-593.54 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -627.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 574.44
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....)((((.(((((..((...........))..)))))((((..(((((((..........(((((.(((.((((((.(((((........(((((...(((((.((..((((.....((((((....))))))........))))..)).)))))....(((((((...(((((...((((((((..(((..(((((.......((((((......))))))..........((((((...(((........)))...)))))).)))))..)))..))))))))....)))))((((((........(((((((........................))))))).))))))..((((((...))))))........))))))))))))(..(((((..(((...)))..)))))..).)))))((((((((.((.......((((((((.((((...((.(((((.(((((((((((..((....))..))))))..((((.((.((..((((...(((..((((..(((((((((.((((((((.....))))....)))).(((((....((..((((((((((((....((.(((((((...((((((((...((((((((..((........))....))))))))...((((.((((((((((.(((.....)))...(((....)))(((.((...(((((((((...(((((((.......))).)))).(((..((((.((.((((..(((.......))).))))))))))..))).)))))))))..)))))((((((((.((((((((((.....))))))))))..))))))))...(((((.(((((((..(((((((((((((..(((...)))..)))))..))))...))))(((((.((..(((....)))..))..)))))(((((....)))))(((....(((((((..((((.((.(((.......))).)).))))............(((((((((........))))))))).)))))))......)))...))))))).))))).........................)))))))))).))))......)))))))).(((((.......)))))..(..((((.....))))..)..))))))).....((((((...(((((((((((((((.((((..........(((((.(((((....((.(((.......))).))))))))))))...........(((.((((.(((((((((...(((((((((.......((((((...((((..((((.(((.....(((....))).....(((((((................))))))).))).))))..))))..)))).)))))))))))...))))))))).).))).))).......(((......)))...((((....)))).))))...))))))).)))....)))))...))))))..))....))))))))))))..))....))))).(((((..((((.((((..(((((.....)))))..................))))))))....)))))...))))))))).......)))).))).))))...)).)).))))...)).))).).)))).))....))))..)).)))))).......))))))))))....))).)))..))).))))).........))))))).))))....(((((................................)))))....(((((.((((((((((.(((((((((....((((..((((..((...))..))))..))))....))))).))))..)))).....)))))))))))....(((((.((((.(....).)))).)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.....)((((.((((({{{,.....,.,....,,{||}}|||,|,,{{{{{{{,,,,......,,,,{.,{,{(((((({,{{(({.{{{{((((((.,,(({{{{{{....(((.....((((((....))))))......})),..,,}.))))})))))|||||(({{{((({(...((((((((..(((..(((((.,,.,,,((((((,,,...||}|||,.......,}||{{{{.,.|{|}}},,}..}))...))}))).)))))..)))..))))))))...,)))))((((((........(((((((..,.,..............}},..))))))).)))))|..{{((((...}))}}|........,}||}}||{,..{||{{{{,..{{{,,.})}..})})}.||,,|}}}((((((({.{{.......(((((((,.{(((...{{.{{{||.{{{|{|(((({..((....))..))}})|,.,{((|((|({,.,,.....,{{..{{{((,(((((((((,(({,((((.....)))),...||||,.{{{{....|{..((((((((((((....((.(((((({,..{{((((((...((((((((..((........))....))))))))...((((.((((((((((((((.....(({...}))....)))|||.{{...{({((((((...{{{{{{{.....,,))).)}}}.{{{..((((.((.(((({{({....,,.,)))..,}}))))))..)}}.}}|||||||,.||||,((((((((,{{{{{|||||,,,,.}))}}}}}|||,|}|||}},...(((((.(((((((..{((({({((((((..(((...)))..))))),,}}})...)))}(((((.((..(((....)))..))..)))))(((((....))))).,..,,,{(((((({.((((.{{.(((.,....,))).)).)))).}..........(((((((((........))))))))).))))))}......,))}..))))))).)))))....,,,,}.)))}..,})))),.,}))))))))).))))....,,)))))))}.(((((.......)))))..|}}||||..{,.||,}||{{{|||||||...}}}|,,,,.}}||||(((((((((((.((((..........(((((.(((((....((.(((.......))).)}))))))))))...........(((.((((.(((((((((...(((((((((.,,..,,{{,,{{,,.,{((,,(({{.(((..,..{{{....,}}.,}..(((((((.........,,.....})))))).}}}.}})},.}}}}.,)))}}},)))))))))...))))))))).).))).))).......,{{......,,}...((((....)))).))))...))))))).)))}...}))))}}.)))))}..)),...))))))))))))..,),,}})})))}|||||,.,{,,,{,,|,.{((({.....}))))...,,||,..........,|||||||{{{{||||,,{{|,,,,,)))......})))).....)))))})),,)},}},}.}})).)))}}.}})),)},,..)))}..}},}))))).......))))))))))....||}|||}..},}.,,})}........,}}})))|..,})},}}}}}......,,}..,,,....}))}}}},.,},,,,,}))}.,.},(((((.((((((((((.(((((((((....((((..((((..((...)),.))))..))))....))))).))))..)))).....)))))))))))....(((({.{{({.(,...}.}))}.)))))))))
Forensic Context

No forensic context available.