Basic Information

Symbol
hsa_SCMH1_0004400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SCMH1_0041
Host gene
SCMH1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:41512090-41541123 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:41046418-41075451 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-162.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -171.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 106.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((....)))))......((((....(((((.....((....))....)))))....))))........((((((((((..........((((((((((((.........(((((..((.((....((....))....))))..)))))...))).)))))))))..))))))))))((((..(((((.......))))).....((((.....))))..((((((((((...)))).....))))))(((((((((((.((((..........(((((.(((((....((.(((.......))).))))))))))))...........(((.((((.(((((((((...(((((((((.......((((((...((((..((((.(((.....(((....))).....(((((((................))))))).))).))))..))))..)))).)))))))))))...))))))))).).))).))).......(((......)))...((((....)))).))))...))))))).))))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{.{.(((((....))))).,..,.{{{{....||{({,....(({.,.,|..,,)|}}},...}}}}........((((((((((..........((((((((((((.,.......(((((..,,.(((,..((....))..,.))))..)))))..,))).}))))))))..)))))))))),||...(((((.......)))))...,||||{.,,..,}})}}((((({((((...)))).....))))))(((((((((((.((((..........(((((.(((((....((.(((.......))).))))))))))))...........(((.((((.(((((((((...(((((((((.,,..,,{{,{{{,,.,{((,,(({{.(((..,..{{{....}}}.,}..(((((((.........,,.....})))))).}}}.}})),.}}}}.,)))}}},)))))))))...))))))))).).))).))).......,{{......,,}...((((....)))).))))...))))))).)))).,,))))
Forensic Context

No forensic context available.