Basic Information
Symbol
hsa_SCMH1_0005100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SCMH1_0158
Host gene
SCMH1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:41514900-41515566
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:41049228-41049894
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-178.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-190.53 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
80.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((..(((((.((..(((.(((..(((.....)))))))))..))))))).))..........((((((((...(((.((((....((((.((.(((((((((((((.................(((((.....))))).((((.....)))).))).)))))))))).))))))....)))).))).(((..((((...))))...)))...(((.((((.((((((((..(((((((((((......((......))......)))))))))))...............((.(((((...))))).))..((((..((((.(((..........))).))))..)))).((((((((.....)).))))))......((((((......))))))..((((((............(((...((((((....)))))).))).........))))))..))).))))).)))).))).......(((.((....)))))..........((((((((((((.(((.(((................))).))))))............................((....)).....))))).))))......(((((((..((.......))..)))))))........))))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,((..(((((.{(..({(((((..({,.....,),))))))..}}))))).,,....,,....((((((((...(((.((((...,((((.((.(((((((((((((.................(((((.....))))).,(((.....)))).))).)))))))))).)})))).,..)))).))).(((..((((...))))...)))...(((.((((.((((((((..(((((((((((......((......))......)))))))))))...,,,......,}}{{.(((((...))))).}}..((((..((((.(((..........))).))))..)))).((((((((.....)).))))))......((((((......))))))..((((((............(((...{(((({....)))))}.,,}..,......))))))..))).))))).)))).))).......(((.((....))))).........(((((((((.(((...,.((({{..............,...,},................,.,.......))).))}}}))))).....,||..,,}}......(((((((,{,(,....,})),.}))))))........))))))))......
Forensic Context
No forensic context available.