Basic Information
Symbol
hsa_SCMH1_0005200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SCMH1_0120
Host gene
SCMH1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:41526090-41526613
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:41060418-41060941
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-138.41 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-148.60 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
127.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.....((((((((((.((...((((((((((((....((((...........((((((((....)))))))))))).)))))))......((((..((....))))))........................)))))...((.((.(((((((((((((.....))))).....))))(((((((((.(..((((((..(((((((.....(((..(((((((.((.((....))))))))))))))...)))))))....))))))..)))))))))).....(((((((((.......(((((.((..........))))))).....)))))).))).)))).)).)).......((((((((((.......)))))))))).....)).))))))))))....)((.......(((.(((((((((((...((((((....................................................))))))))))))))))).))).......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..,{{{{(((((({(,({,...,{{.(((((((.{{.({,,.........{{((((((((....)))))))))))).)))))))..,...{{{{..{{....}))}))...........,{{,,....}}}}}...(((((...,,,)}}}}.,(((((.....)))))..{{{{|||(((((((((.(..((((((,.(((((((.....(((..(((((((.(,{((....))))))))))))))...)))))))..,.))))))..))))))))))...,{((((((({,...,,,,,((({.,{.,,.....,,))})))).,))))))}}}.,,,,}.,,.,,,})}..,,,.((((((((((,....,,,))))))))).....}}.}}}}}}||||||..}{{.......(((.(((((((((((.,,(((({{...,,,,,.,..........................................))))}}))))))))))).)))...,,,,))
Forensic Context
No forensic context available.