Basic Information

Symbol
hsa_SCMH1_0005900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SCMH1_0121
Host gene
SCMH1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
1:41536267-41539116 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:41070595-41073444 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-957.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1008.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 476.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((...((((...((((....((...))..)))).....))))..(((...((((..(((.((.(((((((.(((((((((((.(((........))).))))((((.(((....((((((.......(((.....)))........((((((...))))))........................))))))(((...))).......)))))))..........(((((((..((((((.((((.((.(((.((((....)))).))).....................((((((.((((.(((((...((((.(((((..(((((((...........((((.((((((((.(((((((..(((((...((((((((.((.(((.(....................).))).)).)))))))).)))))....((((.(((((.(((......(((..(((..((((.....(((((((.((((((((...((((.((((.............(((((.((((((((((...(((((((.(((((.(((((((.............(((((..(((((((((((((((((..((((((...((((((((.(((((((((((........(((((((((.(((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((((((((((((..(((((((.(((((...(((.(((((((((......(((((((((.((((((.((((.(((((((((.(((((((((((((.((((((....(((((.(((((((.((((.(.(((((((.((((.((((((((...(((.(((((((((((.((((((.......((((((((((((((((.((.((((((.......))))))))..(((((((.(((((((.....((((...)))).....))))......))).)))))))(((((((...(((.((.......)).))).((((((((......).)))))))...(((((((..((((...((((........))))...)))).)))))))..(((((...(........)..)))))......((((.(((((.....))))).)))).((((...(((((((((((......)))))..))))))))))...))))))).(((....((((((((.(((((((..(((((((((((((.....((((..(((((....))))))))).....)))...((((((((((((((..((...(.(((((((((......((...((((((.(((.....((((((((((.((((((.((((((....))))...)).)))).)).))))).)))))))).)))))).)))))))))))).)).))))))))))))))))))))))))..)))))))...))))))))....))))))..))).)))))))))).....)))))).))))))))))).)))...)))))))).)))).))))))).).)))).))))))).)))))..))))))...)).))))))))))).))))))))).)))).)))))).)))))))))..))))))))).)))...))))).)))))))..))))))))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))).)))))))))........)))))))))))..))))))))...))))))..)))))))))))))))))..)))))((((((((((...))))))))))...((((((((((((((...........((((.......))))(((((((((((((((((...((........)).)))))))))))))))))...................................................(((((((((((.......)))))))))))............)))))))).))))))...))))))).(((((((....))))))).........((((.(....))))).............)))))..))).......((((((((.(((.....(((.((((.((((.((........((((((((...))))))))....)).)))).)))).)))..........))).))))))))..)))))))))..)))))...))))).............)))).))))........))..)))))).)))))))))))..)))..)))))).)))))))))((((((((((((((((((((....((((.((((((.....)))))).))))((((((((.((((..........)))).))))))))..((.(((...(((......)))....))).))))).))))))).)))))))))).........((((.((.......((((((....))).)))((((........))))...............)))))).........)))))))..)).)))))).))))......(((((..(((((((..((((......))))..(((...))).)))))))..)))))(((((((((((.......................)))))))).))).))))))).))))).)))).((((.(((((.((((..((((.....)))).....)))).))))))))).........((((...))))...........))))))))).))))))......)).))))...))))))...)))))))...))))).)).)))))))))..)))))))...)))...(((.....))).)).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((.,.((((,..((((,,..{{...}}..))))..,,,|||}..|}}}||({{(,((({.((,(((((((,({{({{(((((.(((........))).)))){(((.{((....{{{{{{.,,,...{{,.....)))...,..{{((.,,...))))|}|,|,..,......}}...,||,...|}}||}((,...})).......}}}})}|,.....,.,.||{{|||,,|{{(((.((({,{{.((,.{(({,...}))},))},,.,.,{,........,...,((((((.((({{(((((...((((.(((((..(((((((...........((((.(((((({{.(((((((.{(((((...((((((((.((.(((.{.,,........,........).))).)).)))))))).))))},,.,((((,(((({.(((,{,,,.,((,,{{,.||||,.,,,.(((((((.((((((,,.,,((((.((((.............(((((.((((((((({..,(((((({.(((((.(((((((.,,..........(((((..(((((((((((((((((..((((((...((((((((.(((((((((((......,.(((((((((.(((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((((((((((((..(((((((.(((((...(((.(((((((((......(((((((((.((((((.((({.(((((((((.(((((((((((.({(((((,.{{.(((((.(((((((.((((.(.(((((((.((((.((((((((...(((.(((((((((((.((((((.......(((((((((((((({(.,(,({,,,{|,,{{(((|||,)))},{((((((.((({(((,{{..{(({...}}}}..,,.})))......))).)))))))(((((((.,,{{,.(({..{{{{|,{|||.((((((((......).)))))))...(((((((..(((({..((((........))))..})))).)))))))..(((((...{........)..)))))..,,,.||||,||,,|}}...})))}.)))}.{{{{...(((((((((((......)))))..))))))}}}}...,)))))).{{{..,.((((((((.(((((((..(((((((((({(,.....,{{{,.(((((...,)))}}},,,...,,),),,.|(((((((((((((,,{(...(.(((((((((......((...((((((.{{(.....((((((((((.((((((.((((((....))))...)).)))).)).))))).)))))}}),)))))).)))))))))))}.)).)))))))))))))}))))))))))..)))))))...)))))))).,..))})}}.,))).))))))))))..,..)))))).))))))))))).})).,.)))))))).)))).))))))).).)))).))))))).))))).}))))))..,)).))))))))))).))))))))).}))).)))))).)))))))))..))))))))).)))...))))).)))))))..))))))))))))))))))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))))).))))).))))))))).,,.....)))))))))))..))))))))...))))))..)))))))))))))))))..)))))((((((((({...})))))))))...((((((((((((((...........,,{{....,..||||(((((((((((((((((...,,........,,.))))))))))))))))}.......,,,,},,.,........,.....................,,...(((((((((((.......)))))))))))............)))))))),}))))),,.))))))).(((((((....))))))).,.......((((.{....})))).|||......,,.)))))..)}}.......((((((((.(((.....(((.((((.((((.((...,....{{((((((...))))))))....)).)))).)))).)))..........))).))))))))..}))))))))..)))))...))))).............)))).)))).....,.,}}..)))))).))))))),},,}))))..},))))}))))))}))(((((((((((((((((((({,{((({{,({((({.....})))}}.,,,.{(((((((.((((..,.......)))).))))))),..,}}||,,,,(({......)))},...))}})))).)))))))))))))))))).........((((.((.{{..,{{{{{{{....}}}||}}{(((........)))}........,,,.}}})))))).....,},.)))))))..}}.)))))).))))......(((((..(((((((.,(,.((.(,,....},,,)}...}),.)))))))..)))))(((((((((((.......................)))))))).))).))))))).))))).)))).((((.(((((.((((..((((.....)))).....)))).))))))))).......,.((((...))))...,.......))))))))).)))))},,....},.}|||,,.|||||}...||}|||}...}}})),)).))))))))),.}},}})),,,,,}},,|||.,.,.)})}}}..,.,
Forensic Context

No forensic context available.