Basic Information

Symbol
hsa_chr1_0870700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SCMH1_0082
Host gene
SCMH1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
1:41537478-41538441 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:41071806-41072769 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-363.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -378.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 181.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((.......(((((...(((((((.((((((((((.(((.(((((..((((.(((((.(((((((((((((((((((...(((((((((((..((((((((.(((((((((.(((((((((((((((((...(((((((((.(.((((((.....(((((.((((.(((..(((...............(((((((.....(((.(((((.((.(((((((((((.((((......((.(((((((((.......(((((((..((((((.((....((((....))))..))))))..))..)))))))........)))))))..)).))....(((....)))...))))))))))))))).......(((.......))).....((((((((...((((((((......))))))))................))))).))))).))))))))..((((((..((((((....)))))))))))))))))))(((((..(((....)))((..(((((......)))))..))..((((((((.(((((((...)))))))(((((((......))))))).....))))))))((.((((((((.((((..(((.((...((((...((((((((.......))))))))))))...)).))).....))))...)))))))).)).......)))))..((((.....((.(((....))).))......))))..)))))))))).)))).)......)))))).).)))))))))...))))))))))))))))).))))))))).))))))))..)))))))))))..))))))))))))))))))).))))).))))..))))).))).)))))))))).....)))))))...))))).......))))))))))((.(((((((((....)))))..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((.....,.{((((...(((((((.((((((((((.(((.(((((..((((.(((((.(((((((((((((((((((...(((((((((((..((((((((.(((((((((.(((((((((((((((((...(((((((((.(.((((((.....(((((.((((.(({.{(((...............(((((((.....(((.(((((.{{.{((((((((((.((((.....{{{.,{(((((((.......(((((((..(({(((.((.,.,((((....)))),}}})))}..))..)))))))........))))))}|{|,,||,...|||.,},})),..))))))))))))))}.......{,,..,....))).....(((((((({..((((((((......))))))))..},............})))).))))}.}))))))}..((((((..((((((....))))))))))))))))))),((((.{(((....}}}||,,{||||.....,}}|}},,}},.,{{{((({.{((((({...})))))|(((((((......)))))))}....}))})))|{||{(((((((,{{{{..(((.{{...((((...((((((((.......))))))))))))...)),))).,}}}}}},...}))))}}}.,}}},,...}))))..((((,....{{.(((....))).}}......))))..)))))))))).)))).)......)))))).).)))))))))...))))))))))))))))).))))))))).))))))))..)))))))))))..))))))))))))))))))).))))).))))..))))).))).)))))))))).....,))))))...))))}.,.....))))))))))((.{((((((({....,))))}.,))}))
Forensic Context

No forensic context available.