Basic Information

Symbol
hsa_SCMH1_0007600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SCMH1_0138
Host gene
SCMH1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:41540891-41608784 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:41075219-41143112 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-256.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -272.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 248.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.......(((((.((((((........)).)).))...))))).....))))(.(((((.........((..(((((....((((((..((((..((.((((((((..((....))..))))).)).).))..))))...........((((((((((((((..(((((((((((((((((.((....))...((......))...((((((..((....)).))))))))))))))))))))....)))..).)))))(((.(((((((((((((........((((..(((.(((((((.....(((...)))....))))))).).))..))))........))))))))).)))))))..)))))))))))))))))))..))..((((.((((.(((((((((......)))))(((((((((((.((((((((.((((((((((.....))))))))))..))))))))))..((((((.((((((.....))))..........((((((((((..((((((.((((((((((((.((..(((....)))..))..)))))(((((....)))))..........)))))..)).))....).)))..)))))..))))))).))))))...((((((((((..........((((((((((((.........(((((..((.((....((....))....))))..)))))...))).)))))))))..))))))))))))))))))).........)))))))).)))).......)))))......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{,......{{(((,.......,.{{{{,...(((((((...((((((.({..{(({..,{((((((((({....,((((((....((((,,..||||}.,,.||||||((,,((....}}.,||}|||.,.,})).}))},...........,,,{((({((((((..{,{((((((((((((((|((,...}}|..,,......,,..,((((((..((....})|}))}}}})))))))))))))..||}||{{||,||,|{{{,(((({((((((((.|......((((,.(({.(((((((.....(((...)))....))))))).,.)),||}})|.....|.)))))))},.}))))),.,|||}}}))}))))),})))||||,.,}}}.}}}},},,,||||}}}.....,{(((((((((((((.(({(((((.((((((((((.....))))))))))|.|||}}}}}.....|||.}}}}}}}}}.})))))}..,})))))).)))))})))))))))}.}..{||{|(((((.((..(((....)))..))..))))){{{||,...}}}}}....}))))}.))))))....))))))),..{{...|{.......)).}}.......((((((((((..........((((((((((((.,.......(((((..,,.(({,..((....))..,.))))..)))))..,))).}))))))))..)))))))))),))}}}(((((.......)))))..,.))))).....,|,|}},.....)
Forensic Context

No forensic context available.