Basic Information

Symbol
hsa_SCMH1_0011000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SCMH1_0034
Host gene
SCMH1
Type of circRNA
Intron-Exon
Location (GRCh37)
1:41608546-41627104 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:41142874-41161432 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-154.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -165.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 189.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((.(((((((..((...........))..)))))...))..))))))))((.....(((((((.(..((((..((((....((((((((((...((((((((....(((.....((((((....))))))......)))...))).))))))))))))))))))).(((((...((((((((..(((..(((((.......((((((......))))))..........((((((...(((........)))...)))))).)))))..)))..))))))))....)))))((((((........(((((((........................))))))).))))))..((((((...))))))....((.(((((((..(......(((((..(((...)))..)))))..(((((..(((.(((...........(((((((....((((....).)))....)))))))...((....)).(((.(((....))).)))................(((((((((((.....)))))))....)))))))...)))..)))))....)..))))))).))...))))..).)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,{((,,,({,.(({,(..,.....,}.},..))}.)||||{..|{{.|||,,,,,(({{{{{(((((,,{({{((((..((((,...{(((((((((.,{((,{,{{{....(((.....((((((....))))))......)))...}}}.)))),)))))))))))))}{(((((...((((((((..(((..(((((.,,.,,,((((((,,,...||}|||,.......,}||{{{{.,.|{|}}},,}..}))...))}))).)))))..)))..))))))))....)))))|{(((({{{{,,..(((((((..,.,..............}},..))))))).||||||{.,,((((...}}}}||,,..{,..,{(({{..{...,,,{{{{{..{{,...}))..))))).,|{{{||,|,,,|((,........,,{{{(({(....{{{{.,..}}})),,.,)))))))|..({....}}.,|{,{{{....))).)))......,,,}})}}},,|)))||||,,}}},....{{{|....,)))),}}}))))}})),)),...,..,||||||.,|,..,,)).,)})))})))))
Forensic Context

No forensic context available.