Basic Information

Symbol
hsa_chr1_0871600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SCMH1_0134
Host gene
SCMH1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
1:41619583-41620872 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:41153911-41155200 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-290.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -315.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 358.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..(((.((((((.....(((((......)))))..(((((........))))).....(((((......)))))....((((((.((((((((...(((..(((((((((((((((((((.(((...))).))............))))))))..............))))))).......((((((.((((....(((..(......)..)))..)))).)))))).(((((((((((........))))))..)))))..((((...((((....))))...))))(((((((((((..(((((((.....(((((((((..((((.(((((..(((((..((((((..((((((((((.((.((((((((((.((((.(((............))).)))))))))))))).)).)).....)))))))).(((((((((((...((........))...)))))).))))).((((...))))(((((..((..(((((((((((((....))))).((((((((....((((((..((((....)))).))))))))))))))................((((((....(((...(((...)))...)))..)))))).(((((....(((((.........)))))..)))))..((((............)))).........(((((((.........))))))).....(((((....(((......)))....))))).(((((((.((.....))..)))))))......))))))))..)))))))....))))))..)))))........(((((((((((.(((((........))))))))))....((((((((((.((((((.........)))))).))))))))))...(((((...(((((((..(......)..)))))))...))))).............))))))..))))).))))....))))..)))))..((((((((.((((.((.(((..............................))).))..)))))))))))).)))))))))))))........)))))))..)))...))).)))))))))))....((((((((.((((((....(((....)))....))))))......))))))))((((((((........)))))))).(((((.(((((((....)))))))))))).)))))))))..))))(...(((((((.......))))))).............)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..((,{((((((.....(((({......}))))..,,,,{........}}}}|{{...,{{{{....{{||||.{{{{((({{{.((((((({,,.(((....|||}|..|||{(((({{.{{,...)))|||{,.......}},))))}|||{{,,{{{{.{((((((({{.......,.((((((.((((....(((..(......)..)))..)))).)))))).|{,,,((((((,.....,.))))))..,}}},(((((({.,((((....,}},{{{|||((({{{((((,,{,((({({({(((,.((((((,(....|.}}}}||,|||||.,,||||||,.((((((((((.((.(((((((((,{((((.(((............))).)))))))))))))).)).)).....)))))))),|||{{((((({...{{.,,,,,..}}..,}}}}}}.}}|||((((,,....,,,,..,,.,,..,|||||||{((({....}}}},.((((((((....((((((..((((....)))).)))))))))))))).......,,,,|,,{{{({{,,.,,,,,,...,,,,||}}},.,}}}|.}}}}}}|||||..,,|||{((.,,|||...||}||}}}||,,||||||.,,,,,,,.{..},,|,{{,.....(((((((.........))))))).,,,}},,.,.,}}|{{,,,}}.}},.{{{,||,,.{((((((.{{.....))..)))))))..}}.)))}))))))}))}.,,.....}}}}},,,||....,,.....{(((..(((({{(((((........)))))))))).)))|(((((((((.((((((.........)))))).))))))))),...(((((...(((((((..(......)..)))))))...)))))...........,,,{(((((((({,((..,{({..(((({....))))),,}.....))))))))))))}})))}}..............................,...)),}})))}})),,,)))),}))},,....))))}}}.,)))}}},))})))}||})},},,..((((((((.((((((....(((....)))....)))))}..,,,.))))))))((((((((........)))))))).(((({.(((((((....)))))))))))).)))))))))..))))(..,(((((({.....,})))))}}.............)
Forensic Context

No forensic context available.