Basic Information

Symbol
hsa_SCMH1_0013100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SCMH1_0078
Host gene
SCMH1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:41629701-41630686 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:41164029-41165014 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-221.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -239.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 250.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((((((((....((((..(((((..((((((((((((((..(((((.((((..(((..(((((......)))))..))).)))).)).))).....((((((.......))))))...........................)))))))).))))))...))))).)))).(((.((....)))))((((((....))))))......((((((((((((((..............(((((...((((((((.........(((..........(((......)))(((.((((((..((((.........))))))))))))).))).........))))))))...)))))...((((((....(((((((((((((((((.......(((..(((..((.(((((((((.....)))))))))...))..)))..)))...))))))))(((((((.(((((.....(((((.((......((((...)))).....)).)))))........((((((...)))))).(((((.(((((((((....(((((((.....((.(((((.............)))))))....)))))))..))))))))).)))))......(.(((((((......))))))).)...)))))...)))))))....))))).)))))))))))).)))))))))))).............)))))))))))))........((((((((.((..(((.(((((..((((((((((....)).)))))))).)))))........(((..(((.((((((..((((.((((((..((..((((((.(((...(((((.............(((.(((.(...........).))).)))..)))))...))).))))))..)).....)))))))))).....)))))).)))..))))))..)).))))...))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,..{((((((((((((....{(((.,{((((,,|{((((((({{{{{,,|||||,{{{||,|||}}||{({,,....})))),.}}},}},..,},})},..,.{{{{{|,,,....}|||||{{{,,,,.....,......,,,,|,..}}}})))).))}}}}}}}})),,.}|||{((,.{({{{{,,,.(((({((,,,.}}}}}}}..,..{(((((((((((((..............{((((,..((((((((.........(((...........{(,.....))|((,,(((({{..((((.........)))),))))))))})))....,....))))))))...))))}...((((((....(((((((((((((((((.......(((..(((..((.(((((((((.....)))))))))...))..)))..)))...))))))))(((((((.(((((,{{,,,,,.{|{{{.....,{{{...|}}},,,{.},|.,,.....})))){(((({...}))))).(((((.(((((((((....(((((((...{.((.(((((.,,........,,))))))).}..)))))))..))))))))).)))))......(.(((((((......))))))).)...)))))...)))))))....))))).)))))))))))).)))))))))))}..,,,........}|||||||}||||......,,||||,,||}||..{,,.{((((,,((((((((((....)).)))))))).||||||.}|}},,||||,,,,,}}||)|,}))||,,,{||{.,{,.{((({{,..||||.({(((,,,,.........(((.(((.{...........).))).)))..,,,},,),)}}}}}}}}}{{||{.{.{|||..|||,}........,,.})),.)))),),,},)}),,)}}.))))}}}},.
Forensic Context

No forensic context available.