Basic Information

Symbol
hsa_SCMH1_0013400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SCMH1_0135
Host gene
SCMH1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:41647744-41648541 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:41182072-41182869 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-187.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -205.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 205.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((...(((((((((.....((((((.....))))))....................))))))))).................((((((.(((((...((((((....))))))..)))))................(((((((((...........)))))))))(((.((.(((.....))))).))))))))).((((.(((((..(((((.((((((.(((((.....((((.((((((.......(((.(.(((((...((((((((........((((.....))))))))....................((((...((((((((......).)))))))..))))..))))..)))))).)))........)).))))))))((((......))))(((((((....((((((.((((............)))).)).......))))....)))))))...)))))....))))))....)))))..))))).))))..............................(((((((.((((((((((((((.((....(((....)))...)).)).)))))).)))))))))))))...))))((((((((..(((((((.......)))))))(((((..............(((((.((((.(........))))).)))))..............((.((((((((((((..................)))))))))))).)).((..((........))..)))))))........))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((,.,,(((((((((.,({{(,,({({{...|||}}}},,..})}....,,},....))))))))}..,,,,,.,{(((({.{{((,,,{(((((...{{((({....||}|||,,....,.,,..,.............,{{{{,...........},|(((((((...))))))}}..((((((((.((((,...{,.....,}...,,.}))).)))))))),{,,...(((({,,,((,........,|.|,|||||...|||{((((,.......((((.....)))))))),...................((((...((((((((......).)))))))..)))),,)))},,)))}}},}}),,......|}|}}})),,|{{||,,.,,,))))|{{((((..|.((((....{{{....,,{{,...,}}}|.,....,..))))....))))))}...}},}}....)}))||,..,}|||||||||,...,...........,...,,},}},,..|{{,...(((((((.((((((((((((((.((..,,(((....)))...)).))}}))))),}))))))))))))...)))){{{{,{,{,.(((((((.......))))))),,,,,............,,(((({.{(({,(,{,....||}}}}.}}}}}..,....||,},..{{.{(((((((((((..................)))))))))))),)).|...)}......{{||{,|{||,,,.}))}}))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.