Basic Information

Symbol
hsa_SETDB1_0002100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0014054 hsa_circSETDB1_009
Host gene
SETDB1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:150912416-150922001 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:150939940-150949525 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-371.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -393.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 283.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((..(((((..(((........((((((((((((((((((....((((((.(((....))).))))..........))....)))))))).))).............(((((((((((((((((....(((....)))....))))).))))).)))))..))....(((((..(((((((((.....(((.........)))............((((((((((..((((...))))..))))..((((....))))(((..(.........)..)))....((((....)))).....)))))))))))))))..)))))...(((((((((((((((((..(((((.(((.......))).)))))..)))))))............((((((((..(((.(((((((...((.((((((...(((..((...(((..(((((((...((((....)))).........))))))).)))))..)))....)))))))).))))))).)))..))))))))((.(((((((...........((((((.((.....((((((((((.(.(((....))).)))))).)))))..))))).)))..((((.....))))..........))))))).)).........(((.((.((((((.(((((.((((.((((.((((((((((((.(((((((......))))...))).))))))(((((.....((((........)))).....(((((((......)))))))(((((...)))))....)))))....(((.(((.((.....))..)))))).)))))).))))...)))).....(((.((.(.(.(((((..((((.(((...((((((((...(((...)))....))))))))...))).........((((.....)))).))))...))))).)).)))))((((((((((((((((.................))))))))...((((((.((.(((....))).)).))))))))))..))))............))))))))))).))))))))).))))))))))))).))))))))...)))).)((((((.(((.((.....)).))))))......((((......)))).....)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((((..(((((..{,,........(((((({((((((((((({({.{(((((.(((....))).))))},........,...,})))))))).))|,({.....|,,{||,(((((((((((((((..,.(((....)))..}.))))).))))).)))))..((((..(((((..(((((((((,,,{.{,,...,{{{.,||..,..........,,,{{(((((..((((...))))..))))}.((({....})))|{{..|.........}..)})....,{{{....,,,,......,)))})))))))))..))))).))))...,{...(((((((..(((((.(((.......))).)))))..)))))))...,........{(((((((..(((.{((((((...((.((((((.{.(((..((...(((..(((((((,,.,{,,....}}},.........})))))).)))))..)))....)))))))).))))))}.)))..)))))))|(({(,(((((......(((((((((,,.(((....((((((((((.(.(((....))).)))))).))))),{|||||.{{{|,,{{(,,...||}}.{{,,|,...}))))}|{|{{{...,}}.|||.||}||,|||}|,|||}||,..,|||}|||||,.,,,||}||.||||,.{{..||||||,||||}}}}|||{{{|||,..{(((,.,.....}))),,,..,(((((,{{{{{{,,,,|||((((({..||}||......|{{{.{{(,({({(.{{.....}}..)),,)).,,))),,)))}..,))}.}}}}}}}|}||}}}}.||}}}...{{{.{{|,,,|||||{{{...{||,,,))),,.|))|||||}..,))),....}}}.((((.....)))).{|||{{{|,|||{(((((,||....{{,,((((((((.................))))))))...((((((.((.{((....))}.)).))))))))}})))))).{{......,.}),,|||,,,,,})),,))).))))))))))))))).}}}))))),..)))).)(({(((.(((.((.....)).))))))......((((......)))).....)))
Forensic Context

No forensic context available.