Basic Information

Symbol
hsa_SETDB1_0005500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0014067 hsa_circSETDB1_024
Host gene
SETDB1
Type of circRNA
Exon-Intergenic
Location (GRCh37)
1:150921846-150937220 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:150949370-150964744 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-923.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -973.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 730.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((....))))...)(.(((((..(((((((((.((((((((((.((..(((...((((..(((....(((((....((.....))...)))))((((((((((.....((((..((((((((.(((((...((((......)))).(((((((.........(((((....))))).(((....)))..............(((((((((((((...(((........)))..)))))))).)))))(((((((((((((..(((..(((((...((((((....))))))....(((((((((((((((.......).)))........)))))..))))))...))))))))..)))))........))))))))........)))))))..))))).)))).))))....((((..(((...((((((((.((..(((.............))).)).))))))))))))))))))).....)))))))))).........)))..))))))).(((((.(((((.((((....)))).........((((.((((((......))))))))))))))).)))))......))))))))........(((((((.....(((((((.(((.((((((.((......(((((((((...)))))))))....((((((((..((.(((((.((((.(((((....((..((((....(((((......)))))..)))).)).))))).)))).(((((.((((..(((..((((((((((((((((((.(((((((.(((..............(((((....)))))((((((.((.(((((...............))))).))......(((.(((.....))).))).......))))))....(((((.....)))))(((.((((.......)))).))).......))).))))).)).))))))....((((((((.......(((........)))((((..((((((((((((.....)))))).((((.(((..((((((((((((((((....((((((......)))).))........))))))))).)))))))))).))))((((..((((.(((((....(((((..((((((.......((((....))))......))))))..(((..(((((.(((.(((((((((.((.(((.(((...((((......))))...))).).)).)).)).)))))))..((((..(((((..(.((.......((((........)))).....)).))))))))))........))).).))))..)))......(((((.(.....)))))).))))).(((((......)))))...........))))))))).))))))))))..))))..((((((......((((.((((((((..........((((((.......)))))).........(((.((((.........))))..)))((((.((.((((...(((.((((((((((....)))))))))).))).)))))).))))((((((.......)))))).)))))))).)))).)))))).))))))))(((((((.....)))))))...(((((..(((((.(((((((.((((((.........((((((........)).).)))..(((((((.(.(((..(((((....)))))....))).)...)).)))))....)))))))))).))).)))))..(((((..((.((....(((((...)))))...))....((((((........))))))..))..)))))...)))))...)))))))))))).))).)))))))))...(.((((.(((....((((((.((((..(((((((.((((((((((((((((.(.(((.((((((((((.(.((.((((((.(((.......))).(((((.(((((((((....((..(((((((..(((...((((((.....((((.((((((((...............(((((..............(((((.((((..((...........(((...)))....(.((((((((.(((...(((....(((((....)))))..)))....((.(((((((((((....)))))..)))))).))((((.........))))....((((.((.((..........)).)).))))...))).)))))))).)......((((((....)))))).....)).)))).))))))))))((((((((..........((((.((((........(((((((.(...........).))))))))))).)))).)))))))))))))).)).))))...))))))....)))..((((..((((((....))))))..))))..........)))))))..))))))))))))))))..))))))..)).).)))))).)))))))).)))))))))...))))))).....((((((....(((.....)))...))))))...((((..((.......))))))..)))).)))..).))).)).))))...))).)))))..)))))))...))))))))((((.......))))......))...))))))..)))..)))))))..)))))))).)))))))))))).((((.((((((((...)))))))).))))...............(((((.((((((...((((((...))))))....)))))))))))..))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({((.,,{||||||,,,|{||{(,((((({{((({(((.,,,,((,((..{{{,{,{,{{..{||,,.,{{(((.,,,((.....}}...}}}}}|(((((((((..,,{,({...,{||{||||{((({...((((......)))).,,{{{{{.........(((((....))))).(((....|}}......,,......(((((((((((((...(((........)))..)))))))).)))))(((((((((((((..{{(..(((({...|||(((....})))),....(((((((((((,,({,......,.,,},....,},)))))..))))))...)))}}))}..)))))........))))))))....{{,.,,,,})),,.|}|||||||{({,{((((({{{.,{.{....,|||,.|.}))))}.}}}},....|{{{|{|.,|.)))))))},)))))}.,})},...)))))))))},|...}}}}))),,)))}))},|((((.(((({.((((....)))}........,((((.((((((......))))))))))))))}.))))}.....,||,,,,,|.,......{((((((.....(((((((.(({.((((((.,(,.....(((((((((...)))))))))....((((((((..{(.(((((.((((.{((((..,.{,,.((((....(((((......)))))..)))).),.})))).)))).(((((.((((..((((,((((((((((((((((((.(((((((.(((..............(((((....)))))((((((.((.(((((...............))))).))......(((.(((.....))).))).......))))))....(((((.....)))))(((.((((.......)))).))).......))).)))))},).))))))....{(((((((....,,.,{{........}},((((|.((((((((((({.....}))))}.((({.((,.,((((((((((((((((.{,,((((((......)))).))..,}}...)))))))))))))))))))).,)))((((.,((((.(((((|...((({(,,{{{,||.,},..}||||}..||||,..,..,},}}}}.,{{{,,||{|,,{{{.(((((((((.((.{({,({{...{{((......))))...}}},),.}.)).)).}}}}})},,{{{,.{(((((..,,{,.....{{((((.,....,.}}}}...,.,,..}||}}}}}},.,,}}}}}{{({((((...)))})))).(((((.{.....}))))).}}}}}.{((({......)))))|||....,,),}}})))))).)))})))))).,))))..((((({......((((.(((((((,,,......,.((((((.......)))))).,,,,....{{{.((((.........))))..}}}{{{|.((.((((...(((.((((((((((....)))))))))).))).)))))).})}}((((((.......)))))),)))))))).)))).)))))).)))))))|(((((((.....))))))),..(((((..(((((.(({((((.((((((.........((((((........)).}.})}..({(({.,...,{{,,||{({.,,.})))}....))),}...}}.))))}....)))))))))).))).)))))..(({((..||.{{....(((((...)))))...||....{(((((........,))))).,)),.)))))...))))).,.)))))))))))))))).)))))))))...{.((((,(((.,,.((((((.((({..(((((((.((((((((((((((((.,.(((.((((((((((.(.((.((((((.(((.......))).{(((,{(((((((((....((..(((((((........{((((((.....((.((((((((((..,.........{(((((({{((((((........(((((((,{{{.........},,}}..}})))(((((.......}))))))))))|....(((((....)))))..(((({..,,...||})))).|}}}))))),.......},,.))))..,))))}..))....))))))|(((((((......(((((.((.(((({...{(((((((|{,..{...((((((....))))))....,},.,},{{{|||||{{.,((({{,,,..,.,,,}}}}}})))}}})})))}},}....})))).)).)))))..)))))))||{.,{|{(|,{{{,{{{{||..}}|}}}}})),|,,,,)))}....}))|((((..((((((....))))))..))))}}........)))))))..))))))))))))))))..))))))..)).).)))))).))))))),.)))))))))...))))))).....((((((..{.{((.....)))}..))))))...((((..,{,....,...)))}..)))).)))..}.))).)).))))}}.))).))))}..)))))}}...))))))))((((.......))))......))...))))))..)))..)))))))..)))))))),)}}}}}))))}}.((((.((((((((...)))))))).))))......,,.{{{{..(((((.((((((,..((((({...}))))).,,.))))))))))).)))).)))
Forensic Context

No forensic context available.