Basic Information

Symbol
hsa_SETDB1_0005900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0014070 hsa_circSETDB1_028
Host gene
SETDB1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:150923841-150936559 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:150951365-150964083 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-485.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -513.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 374.99
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((((((.(((..............(((((....)))))((((((.((.(((((...............))))).))......(((.(((.....))).))).......))))))....(((((.....)))))(((.((((.......)))).))).......))).))))).)).)))))(.........(((((.(((..(((((..((((..........((((((((.(((.(((......(((((((..(((((((((((((((((....((((((......)))).))........))))))))).)))))))).......)))))))....((((((...(((.((.....)).)))..))))))..((((...)))).....))))))))))))))))))..)).))).))).))))).(((.((((((((...((((((.(((...((((..(((((.((((........)))).............((((........))))...((((((((.....((((..(((...((((((.(((((...))).(((((.(.....))))))..((((..(((......)))))))........(((((((.((..........)).))))))).)))))))))))..))))....)))).)))))))))....))))....))).)))))).....(((.((((.........))))..)))((((.((.((((...(((.((((((((((....)))))))))).))).)))))).)))))))))))).))).((..((((((((((((((..(((((((((((.(((((((((((.....))))))))..(((((.((.((((((((.((((((.(((((.((...(((((((.....((((((((((.((((((.....((...(((((....)))))...))..........((((.....((((((..((....))...))))))....)))).....(((((...)))))..........((((((((..(((.(((.((...((((.......)))).)).))).)))..(((.((((((((((.....)))...(((....(((......)))....))).))))))).))).))))))))....)))))).))))).................))))))))).)))((((......))))..((((.((..........)).))))...(((((.((...(((........)))....)).)))))((((((........(((((((.(((.........)))))..)))))(((((.......))))))))))).....(((((....)))))..(((((.........))))).)).))))).)).)))).)))))))).)))))))(((((..((((((.............(((((((......))).))))..))))))..)))))((((((....))))))..)))))))))))))).))))))))))))))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.((,(((,,((({{{..,,...,{{{(((((...{||,,|(((((({((.{{{{{......,,,,...,,|||}}.}}.,....{((.(((.....))).))),{{{...}))))}....(((((.....))))){{{.{(((.......}}}|,||},......}}},})))),,).))|||(...,}}},|{(,,{.|||..,,.,|,..,.||,..,|}}}}}||||||..|||}|||}}}}}.((({.((,.{((((((((((((((((.{,,((((((......)))).))..,}}...)))))))))))))))))))).,)))}}))))),||,{{,{||,..|{|,||,,,,,||.}}}..}||||}..|}}}}..,..,}}}}}),,,||||||||||||||||.,,|},.}))}),))}||{{.(((((((({..((((((.(((...((((.,(((((.((((.,....}.)))).............((((........))))...((((((((.....{({{..{(,...((((((.(((((...))).(((((.{.....})))))..(((,.{(((......))))))).,......(((((((.{(..........}).))))))),)})))))),,,.,))}}.,,.)))),,))))))))..,.))))....))).)))))).....(((.((((.........))))..))),{({.((.((((...(((.((((((((((....)))))))))).))).)))))).)))))))))))).}},.{{..((((((((((((({..(((((((((({,(({((((((((.....))))))))..(((((.((.((((((((.((((((.(((((.((...((((((,....,((((((((((.((((((.....,({,,(((((....))))}...,},}.,......|(({.....{(((((..{{,,..||,,.)}}))}.,,.))}|,....(((((...)))))...}}.....((((((((..(((.(((.((...((((.......)))).)}.)}).))},,(({,(({{({{(((.....)))..|{||,.,,||{,,,,,,|}|....}}}.)}))))),)}).))))))))....)))))).))))),,{............,.})))))))).))).|{(||.{{.||||,.((((.{(.......,..)).))))...{{{((.{{..|{{|,.......})}.)}}}},|}}}|((((((........((((({(.(({........,)}}))..)))))(((((.......))))))))))),..,,{((((....))))}..(((((.,,....,,))))).}),))))).)).)))).)))))))).))))))){((((..((((((.{,..........,,,||{|..,,..}},.,}}}..))))))..)))))((((((....))))))..)))))))))))))).))))))))))))))..)},
Forensic Context

No forensic context available.