Basic Information
Symbol
hsa_SETDB1_0007000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0014071
hsa_circSETDB1_032
Host gene
SETDB1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:150933039-150935195
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:150960563-150962719
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-241.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-255.83 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
215.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((.(.....).)).)))))(..((.((..((.((((...((((((..((((.((((((...(((.((.....)).)))..)))))).))))...((((((((.......((((((.((((..(((((((((.((.(((.(((...((((......))))...))).).)).)).)).))))))).(((((.((((((...((......((((((.((...(((((.(..((....(((((........)))))((((((((...)))))))).(((((.(.....)))))).))....).)))).)...))))))))......))...))))))....(((((((....(((....)))......((((.((((((((..........((((((.......)))))).........(((.((((.........))))..)))((((.((.((((...(((.((((((((((....)))))))))).))).)))))).))))((((((.......)))))).)))))))).)))))))))))........((((((((.....))))))))..)))))......((((...)))))))).).)))))..((((((........)).).)))..(((((((.(.(((..(((((....)))))....))).)...)).)))))...))))))))...((((((((....)).)))))))))))).(((((...)))))...(((...((((((........)))))).))))))).))..)).)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.((.,.....}.)}.)))))(..((.((..((.((((...{(((((.{((((.((((((...(((.((.....)).)))..)))))).))}}},.((((((((.,({{{{((((({{{{((,.((((((({{.{{.{({{({(...((((..,,..||}}...,}}}}..|,|},||.|}}}}})}||||,.((((((...{{.,....((((((.{,...,{{{{|...,.....|{{||,,,,..,,}}}}}((((((((...)))))))).(((((.{.....}))))).,},...,{||,,.,..}))))))))....}.))...))))))....(((((((....(((....}}}......((((.((((((({{,......,.((((((.......)))))).{,,,....({(.((((.........))))..})){{({.((.((((...(((.((((((((((....)))))))))).))).)))))).}))}((((((.......)))))),)))))))).)))))))))))........((((((((.....)))))))),,))))).},.,}}||},,})}||)))).).)})),..|{{|{{........}|,|{|||{{(,{{,......|.}}|||||.}},,}},,..}))))}}...,,.,}}},.,.})))))))...((((((((....)).)))))))))))}.(((((...)))))...(((...{(((({,.......)))))).)))}))).))..)).)).)
Forensic Context
No forensic context available.