Basic Information

Symbol
hsa_SETDB1_0001700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SETDB1_0070
Host gene
SETDB1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:150902443-150922001 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:150929967-150949525 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-420.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -445.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 347.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.....))((((((((....))))))))..........((((..........))))((((((((((((.........(((((((((((((........((((((((((.(.((....)).).)).)).))))))..(((((((((((((.((((((((.(..(((.....(((....(((((((((((....((((((.(((....))).))))..........))....)))))))).)))))).....).))..).)))))))).)))...........))).)))))))..((((((((.......(((....((.((((......)))).)))))...((((.....)))).............(((((..((((...))))..)))))))))))))..)))))).)))))))....((((......))))............)))).))))))))((....)).)))))))(......(((((((..(((((.(((.......))).)))))..)))))))(((((...(((.((((((((..(((.(((((((...((.((((((...(((..((...(((..(((((((...((((....)))).........))))))).)))))..)))....)))))))).))))))).)))..))))))))((.(((((((...........((((((.((.....((((((((((.(.(((....))).)))))).)))))..))))).)))..((((.....))))..........))))))).))........((((((((((((((.(((((.((((.((((.((((((((((((.(((((((......))))...))).))))))(((((.....((((........)))).....(((((((......)))))))(((((...)))))....)))))....(((.(((.((.....))..)))))).)))))).))))...)))).....(((.((.(.(.(((((..((((.(((...((((((((...(((...)))....))))))))...))).........((((.....)))).))))...))))).)).)))))((((((((((((((((.................))))))))...((((((.((.(((....))).)).))))))))))..))))............)))))))))))...(((((..((((((....((.....))...))))))..))))))))))))).....)))...)))))......((((......)))).......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((,{,.,,,{{{(((((((,,..}}|}}}}},,.,,||.,|{{{||,,,,|},|.||||((((((((((((.........((((((((((((({.......(((((({{{(.(.((....)).).)).}),}))))).,(((((((((((((.((((((((.{..(({.....(((....(((((((((((,((.{(((((.(((....))).))))}.........,...}})))))))).)))))).....}.,),,).)))))))).)))...........)))}})))))),.((((((((.......((,...{((.((((......)))).)))}}...{(((.....,,,},,,..........{((((..((((...))))..))))})))))))),.}))))).)))))))....{,,,......}|}|............)))).)))))))){(,...}}.}}))})}(,{{...(((((((..(((((.(((.......))).)))))..))))))),{{{{....,..{(((((((..(((.{((((((...((.((((((.,.(((..((...(((..(((((((.,.,,,,...,}}},,,...,...})))))).)))))..))).,,.)))))))).))))))}.)))..)))))))}((.(((((((......{,,{(((((((.{{{,,..((((((((((.(.(((....))).)))))).))))).}}}})}.,}}},{{{{,,...,))).||..,....))))))).)}........{{||{{{|{{{|||,|{{{{,|(({.{{||.{{({{({(({{(,(({((((......||||,,||||.}}}}||(((((,,...{(((,.,,....}))).,,..{((((({,,,,,,}}}}|||(((((,..|}}||....},|||{.,{({(,({(.{{.....}}..))}})).}})))}.))))...))},,,,,||||,||}|}|.|||||..,{{{.{{|,,||||||{{{...{||}.,))).,.})))|))|,..,))),....,,,.((((.....)))),||||,,,|}|}|,||{||}}}},,,{{,{{(((((((.................))))))))...((((((.((.{((....))}.)).))))))))}})))))).|,......,.,)}}|||}}}}},,,{{||{..||||||,...||,,,..})..,)}}}}}..}||}}|}}}|||}||...,})},})))))}}}...((((......))))...,.,,)
Forensic Context

No forensic context available.