Basic Information

Symbol
hsa_SETDB1_0002700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SETDB1_0035
Host gene
SETDB1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
1:150914546-150919633 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:150942070-150947157 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-429.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -454.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 306.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((.(((((((.((.........)))))))))..)).((((((.(((......((((.....)))).................))).))))))..(((((((..(((((....((((((....)))))).....)))))))).((((....))))...((.(((((((((((.((.....)).)))).......)))))))))................(((((((((((((((((...(((((.(((((....((((........)))).....))))).)....(((((((((((...(....)...)))))))))))..))))...)))))))))))).)))))(((....)))..(((((.....))))).....................))))........))))(((..............(((((..(((((((..((((((.(.(((.......))).)....(((((((((((((.(((...(((((.(((...((((((((.......(((....((.((((......)))).)))))...((((.....)))).............(((((..((((...))))..)))))))))))))....))))))))........((((......)))).......(((((.(((....(((.(.(((...((((.....))))...(((((((..(((((.(((.......))).)))))..))))))).............(((((((..(((.(((((((...((.((((((...(((..((...(((..(((((((...((((....)))).........))))))).)))))..)))....)))))))).))))))).)))..)))))))(((((.(((((......(((((((((...(((....((((((((((.(.(((....))).)))))).)))))(((((((.((((.((((.....)))).(((((....))))).((((((...))).))).).))).))))).)).)))....))))))))).....))))).))))).))).).)))....))))))))(((((.....((((........)))).....(((((((......)))))))(((((...)))))....)))))...((....)).))).))))))))))))).....((((((((..((((....))))..)))))))).)))))).))))))).)))))..((((...(((((((((((((..((((.....))))...)))))).....)).)))))...))))......(((((((((((...............))))))))))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({,({.(((((((,((,,.......|||||||}}..,,.((((((.(({......((((.....)))).................))).)))))).||{{{(|,..(((((....((((({....}))))).....)))))|||{((((.{,.||||...{(.((((((({{{{.((,....)).)))}.......)))))))}}................(((((((((((((((((...(((((.(((((.{((((((........))),.}))}))))).)....(((((((((((,.,,....).,.)))))))))))..))))...)))))))))))).)))))(((....)))..(((((.....))))}...................,.}},,.,,},,..,,,}{{,......,,.,,...(((((..(((((((..((((((.{.(((.......))).}....(((((((((((((.{((,..(((((.{(({,.((((((((.......(({...{((.((((......)))).)))}}...{{((.....,,,},,,..........{((((..((((...))))..))))})))))))).,}})}})))))..........,{{{{,..,{{{,,,....,{{{..,,,}}}.||}}||||,.,}|,|.,},}}},}|...(((((((..(((((.(((.......))).)))))..))))))),,,}........{(((((((..(((.{((((((...((.((((((.{.(((..((...(((..(((((((,,.,{,,....}}},.........})))))).)))))..)))....)))))))).))))))}.)))..)))))))|((({.(((((......(((((((((...(((....((((((((((.(.(((....))).)))))).))))){{(((((.{(({,,{{(,,...||||.{{{{|,...}))))}|{|{{{...}}}.})).}}))).))))).)},)))....))))))))).....))))).})))},|||.,,||{{{,,|.||))))||,|,......{{{|,,|,.},}))).,,..||{{{{{....,,})})))){((((...)))))....,,}}}}},||},,,,,.))).))))))))))))).....((((((((.,((((....)))),.)))))))).)))))).))))))).)))))..|,||}..{,{{,,(((((((..,{{(.....)))}...)))))))....,}.))))).}})))),..}},|(((((((((({........}),...,}))))))))}.,,}
Forensic Context

No forensic context available.