Basic Information
Symbol
hsa_SETDB1_0004300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SETDB1_0064
Host gene
SETDB1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:150917394-150931823
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:150944918-150959347
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-521.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-544.88 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
409.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((.((((((((.((.....((((((((((.(.(((....))).)))))).)))))..)))))..)))))..(((((..(((((((((((.((((((..(((((.(((....)))((((((.(((.(.((.(((..((((.((((((((((((.(((((((......))))...))).))))))(((((.....((((........)))).....(((((((......)))))))(((((...)))))....)))))....(((.(((.((.....))..)))))).)))))).))))............((((((((...((.(((.((((.(((...((((((((...(((...)))....))))))))...))).........(((((.((.(((.(((((((((.(((((((((.......((((((((((((.................))))))))...((((((.((.(((....))).)).)))))))))))))))).((........))..(((.....)))..))).))))))))).)))...(((((.((..((((.(((((....))).))..))))....)).)))))..((((......))))..................)).))))).)))).)))))))))))))...........(((((((((((((...(((........)))..)))))))).)))))))).))).))).))))))....((((...)))))))))...)))))).(((((((((((((((.......).)))........)))))..))))))..)))))))))))))))).........(((((((....((((.....))))..)))))))((((.(((((((((..........)))....)))))).))))..........(((.(((....))).)))(((((.((.((((((((((....(((((((.(((((........(((((.(((((.((((....)))).........((((.((((((......))))))))))))))).)))))(((((((........(((.....)))......)))))))))))).)).))))).....))))((((((((...)))))))).(((((.(((((...)))))(((...((..((........))..)).)))(((((......))))).((((((....((((((((.((.......))..((((((.((((.((((.((((((.(((((((.(((..............(((((....)))))((((((.((.(((((...............))))).))......(((.(((.....))).))).......))))))....(((((.....)))))(((.((((.......)))).))).......))).))))).)).))))))....)))).)..))).))))))..))).)))))..)))))))))))(((((.....)))))).))))))).)))))))))))..(((((....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((({.,{((((((.{{,,,..((((((((((.(.(((....))).)))))).))))).}))))).,))}},..(((((..(((((((((((.((((((..(((((.,{,...,||.((((((.(((.{.((.(((..,,,,.{{(((((((,{({((,,((({{....,||{{{{|,,.,}))))||,{{.{,..{((({{{,{.{{{|||,,...{(((((,{{{{{{,,,,|||(((((,..|}}||....,.|||{.{{(,({({{.{{.....}}..)),}}},,,)))},)))}..,}},.,,,,}||||||||}}.||}||..,(((.(((,.,({{{{{{{...|||,..))}.,.,|}|||||}..,))),....}}}.({((,....|||}(((((((((.(((((((((.,,....,,,,((((((((.................))))))))...((((((.((.{((....))}.)).)))))))),,)))))).((,.....,.))..(((.....)))..))).))))))))).})),..||||||||,}||||,|{{|||,..}||.||..,}}),.}}))})))}...{{((......)))).....,,|,,,......{||{|....}))))})))))))}),,))})}}}.,,...(((((((((((((...(((........)))..)))))))).)))))))).))}.))).))))))}}.,{{{{...)))))))))...)))))).(((((((((((,,({,......,.,,},....,},)))))..))))))..))))))))))))))))........{(((((((...,(({,....,))}}..)))))))|(((.(((((({{{,{,.,.....})}..,.)))))).))}},,...,,,.,(({,{{|||}|))|.}||(((((.((.(((({{{(((,...(((((((.(((({,,......(((((.(((({.((((....))))........,((((.((((((......))))))))))))))).)))))(((((((........{,,.....,))......)))))))))))).)).))))).....))}|((((((((...}))))))),{((((.(((((...)))))(((...((..((........))..)).)))(((((......))))).{|{||{....{{{{{{{{{{{{{{|,|,||..{{{{|{|{({({(({{.((((((.(((((((.(((..............(((((....))))}((((((.((.(((((...............))))).)).,....(((.(((.....))).))).......))))))....(((((.....)))))(((.((((.......)))).))).......))).)))))},).))))))....))))})},}))})),,,,..,}}.)))))..})))))))))){{{||,,,,.|)))}|.}}}}||}.}})))})))))..{(((|....}))))
Forensic Context
No forensic context available.