Basic Information

Symbol
hsa_SETDB1_0004400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SETDB1_0043
Host gene
SETDB1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
1:150918541-150920181 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:150946065-150947705 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-629.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -657.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 346.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.(((..((((((((.((.......))))))))))..).)).)((((.((.(((((.((((((((((((.(((((.((...(((((((..(((((((.((..(((((((...(((((((((((((((((.(((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((.((((.(((((((((((.((((((((((..(((((((.........(((((((((((((.(((((((((((((((.((((((((............)))).)))).)))..((.(((((((((((...(((((((((........)))).)))))....(((((((....)))).)))((((......(((((....)))))....)))).......(((((((((...((((..(.(((..((..(((.((((.((((...(.(((((.(((....)))))))))...))))))))....))).))))).)..))))........))))))))).....)))))))))))...))(((.........)))....(((.((((...)))).))).((((...))))....((((((((((((..........(((((((((((.(((((.((((.((((((((.....)).)))))).......(((...)))(((((((....(.(((((......))))).)......)))))))))))..)))))))).)))))......)))....((((((((.....)))..)))))(((((((((((((..((....(((.(((((((((((...(((..(((...)))))).)))))).))))).)))....(((((((.....((((((.(((((((.(((((((.(((........)))))((((.....))))........((((....((((((((..((((....))))..)))))))).....))))((((((((((((((((.(((((.((......))((((.(((((((((((((((.((......)).))))))).((((.(((((((((((((((((..((((((......((((((((((....))).((.(((.(((.(((((.((........)).)))))..))).))).)).)))))))))))))..((((((((.(.....).))))))))((((((((....))))))))))))).)))).)))))...))))))).)))))))).)))).))))).)))))))).))))))))...........(((((...((((((..........))))))))))))))))...))))))).))))))......)))))))..))..)))).)))))))))...(.((((.(((.........))).)))).)..(((((....))))))))).)))))))))))))))))))).)))))))))))))..........)))))..))...)))))))))).))))))))))).)))).))).))))))))))))))))))))))))))))).))))))))..))))).)))))))))))))))))...)))))))...)))))))))..)))))))...)).))))).)))))))))))).))))).)).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((.,((((((((.((.......))))))))))..},)).)((((.((.(((((.((((((((((((.(((((.((...(((((((,.(((((({,((..(((((((...(((((((((((((((((.(((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((.((((.(((((((((({.(({(((((((..(((((((.........(((((((((((((.(((((((((((((((.((((((((............)))).)))).))).{(({(((((,{{{{{,,..||||}|||}}........,,.,,},|({({((({(((....}}}}.))){{,,,}}}},{((((....})))},,,,)))},.......,,(((((((,{(((({...||}}}.|||.}}}{(((.((((...{.(((((.(((....)))))))),...)))))))),,,,(((,.,.(({.......|||,,.}}}}{((({......})))).,,,}|||,,},|||......{{{|||{,{.,,,,,,...})))),.},.)}))},...,}}..,.((((((((((((..,{{,....,{,((((((((.(((((.((((,(({((({(,,,,.,}.}})))),......|||..,)))(((((((....(.(((((......))))).}......)))))))})))..)))))))).))))),.....,}}....(((((({{.....)),.})))))(((((((((((((..((,,..(((.(((((((((((...(({..(({...)))))).)))))).))))).)))..,,{((((((..,,.((((((.(((((((.(((((((.(({........}}}||((({,...,}}}},,|,.,,.((((....((((((((.,((((....)))),.)))))))).....)))){(((((((((((((((.{((((.((......}}((((.((((((({{{(((({,{{..,..,}),|||}}},.((((.{{,((((((((((((((..{(((((....,,(((({{,{{|....})).||.||{,{|(.(((((.((........)).))))).,.}}.}||,|}.,))))),)))))}..((((((((.(.....,.)))))))){(((((((....))))))))))))).)))).))))).,,}},)))).)))))))).)))).))))}.)))))))))))))))}},,,,.......{((((...((((((..........))))))))))))))))...))))))).)))))).,,...))))))}..))..)))).)))))))))...{.((((.(((.........))).)))).}..{{{{,....})})))))).)))))))))))))))))))).)))))))))))))..........)))))..))...)))))))})).})))))))))).)))).))).))))))))))))))))))))))))))))).)))))))).})))),.)))))))))))))))))...)))))))...))))))))),.)))))))...)).))))).)))))))))))).))))).)).))))
Forensic Context

No forensic context available.