Basic Information

Symbol
hsa_SETDB1_0006300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SETDB1_0037
Host gene
SETDB1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:150930198-150930591 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:150957722-150958115 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-178.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -183.09 kcal/mol
Frequency: 0.0008
Diversity: 42.95
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.