Basic Information

Symbol
hsa_SHKBP1_0000200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0051096 hsa_circSHKBP1_002
Host gene
SHKBP1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
19:41083064-41089623 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:40577158-40583717 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-441.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -461.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 369.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((.((...((((((((((((.(((((................((((((((((((.............(((((((......((....)).......)))))))..(((((...........)))))..))))))))))))((((((((..((..(((((....(((....)))))))).((((((.((((((((....((((((((......(((.(((((((((((.((.((((((.((..((.....))..)).))))))))......(((.(((((......))))))))(((.(((((((((..(((((((((((.((((((((((....(((.....)))....))).)))))))....((((.((.(((((...((.((....)).))..))))))))))).(((..(((.((.(((((.((....(((.(..((((((.......))))))..)..))).....)).))))).....)).)))..))).))))))).)))))))..)))))).)))........(((((..((((((((....))))))).)..))))))))))))).((((((....))))))....((((..((((.((......)))))).))))(((.((((.(((((......))))).)))).))).(((((......)))))..(((((((.(..(((((((...........((((((.(((((.(........).))))).)))))).............((((((....))))))(((((.(....))))))))))))).).))))))).))).)))((((((......)))))).......)))))))).)))))).))))))))))..))))))))...(((.....)))....(((......)))......))))).)))))).)))).)).....)).)))((((..((.((((.((.....(((......(((.((((..((((((.((((((..((((((((((.((.....(((((.......))))))))))))....((((..((.((.((...(((((........)))))..)).))..))..))))))))).)))))).)))))).))))..)))))).....)))))).))..)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{{(({,((.,{((((((((((((.(((((((({{,,,,{{{{{..((((((((((({........,...,((,,,((......{,.,,{|,.......))))}}}..{((({...........})}}}..)))))))))))},{{{{{,{,.|,.,|||||},..|||}}...,,,,,,,{((((((.((((((((....((((((({,,,,{,(((,,,{((({{(({..||{|||{{.{{,.{({,,,,}}.,}},}||}|||},.....{(,{(((((......))))))}|(((|((({{{{{{,.{{{,{{{||{|}|||||||||{{,,,{,,{,,....}.}))..}})))}}}},..,((((.{({(((((...((.((....)).))..)))))))))))|(({..|||.,{,||(((,,(,{{,(({.(..((((((.......))))))..){{}||,....,,,))}))....,||,|},..,}),))))))),)))))}}..)))))).))).....,,.(((((..((((((((....))))))).)..)))))})))}}}},((((((....)))))}...,((((..((((.((......)))))).))))(((.((((.(((((......))))).)))).))}.(((((......)))))..(((((((.{..(((((((,.......||.((((((.(((((.(.,....,.).))))).))))))..},.........((((((....))))))(((((.(....))))))})))))).}.))))))).}||||||((((((......)))))}..,,.,,)))))))).)))))).)))))))}},,,|},,}})}...(((.....)))....{{{.....,))),,....))))).))))))}}))).))...,.}},)}}|(((..((.((((.{(.....(({......{{{.((((..((((((.((((((..((((((({{..,,.,,||{(({{.......))))}}}}))|}....,{{{,,||,||,|{...(((((.,....}.)))))..|},)}......)))}))))).)))))).)))))).)))),.}))))).....)))))).))..))},.
Forensic Context

No forensic context available.