Basic Information

Symbol
hsa_SHKBP1_0001000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0051102 hsa_circSHKBP1_008
Host gene
SHKBP1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
19:41086230-41089623 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:40580324-40583717 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-308.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -320.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 271.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...((((((..(.(((((..(((((((.((((((((((((.((....(((.(..((((((.......))))))..)..))).....)).)))))....(((((......)))))..))))))).)..))))))........((((((((((..((((((((....))))))).)..))))).(((((((((..(((((((...(((....)))...((((.((......)))))).....(((.((((.(((((......))))).)))).))).(((((......)))))..(((((((.(..(((((((...........((((((.(((((.(........).))))).)))))).............((((((....))))))(((((.(....))))))))))))).).)))))))..((((((((((((((((..((((((((.(((..(((....))))))))))))))..))....)))).....))).))))))).....)))))))))))))))))))))........))))).)....))))))))((((..((.((((.((.....(((......(((.((((..((((((.((((((..((((((((((.((.....(((((.......))))))))))))....((((..((.((.((...(((((........)))))..)).))..))..))))))))).)))))).)))))).))))..)))))).....)))))).))..)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,.,(({(((..({({(((..,{(((,(,((({,(({{(((({({{((((,.(..(({(((..,,..,}|||}}..}((.(({......})),)}....,{|||}....,)))))}})))))))),..}))))}.,,,,...{((({(((((..((((((((....))))))).)..))))).||{{{((((,{((({{{{,|,|||....{(((..((((.((......)))))).))}}(((.((((.(((((......))))).)))).))).(((((......))))),,||||{{|,.,,||||{{{,....,.,||.||||||,{{{{{,|,.,,,,|,|.}||}}.}|||||..|,.........((((((....)))))){(({(,(,,.,||}}}},}))))),,,)}}))}}..(((((((((((({{{{..({{(((((((((,.((({{..||||||}}|||}||,,|||,...,})},,,.|||.},,,)))..,,)))}))))))|||||||}|}||{|{{,..{||||}.,....}}}})|}|((((.,((,(({(.{(,,..,(({......|||.|{||,.{||{{{.{{{{||,,|||||||||..,,,}}}}|||||.....,,}),)))))))|}.....|||}},|.||}||,,,|||{{,..,,,|{}}|||..||{,,....,})})))}))).)))))}.)))))),))))}.)),))),..,,)))))),))..}))),
Forensic Context

No forensic context available.