ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_SHKBP1_0003500
Basic Information
Symbol
hsa_SHKBP1_0003500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0051113
hsa_circSHKBP1_021
Host gene
SHKBP1
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
19:41096150-41097305
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:40590244-40591399
UCSC (hg38)
External Database
circbank
circBase
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-315.10
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-324.88
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
58.80
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
(((((((((((.(((((..(((((.((((..........))))))))))))))))))))))(((((((.((((.(((.((.....))))))))).((.....))....(((((((((........)))))))))((.((((((((....(((((((((..((((((((((.(((.(((((.(((((((.((((((((..(((((((((((...(((((....(((.((((((((...))))))))...))).........(((((((......)))))))...................))))).)))).)))).)))..))......)))..))).)))))))))))).)))...((.....)).)))))))))).....))))))))).((((((.((....)).)))))).(((...((((..(((.((((((((((.(.((.((((((.............)))))).))..).))))).)))...)).))).)))))))(((((.((((..........)))).)))))......((((..(((((....((..((((.(((((((((((((((((.(((((......))))).)))).((((...))))...))))))))))))).)))).)).....)))))..))))...)))))))))).(((((.........)))))......................)))))))...)))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
(((((((((((.(((((..(((((.((((.......}..))))))))))))))))))))))(((((((.((((.(((.((,...,))))))))).((.....))....(((((((((........))))))))).(|((((((((..,.(((((((((.{((((((((((.(((.(((((.(((((((.((((((((..(((((((((((...(((((....(((.((((((((...))))))))...))).........(((((((......)))))))...................))))).)))).))))}}))..)}.....,)))..))).)))))))))))).)))...((.....)).)))))))))).,...))))))))),((((((.((....)).)))))).(((...((((.,(((,({((((((((.{.((.((((((.............)))))).))..).))))).))),,,)),}}).)))))))(((((.((((.,........)))).)))))......((({..(((((....((..((((.(((((((((((((((((.(((((......))))).)))}.{(((...)))}...))))))))))))).)))).)).....)))))..})))...))))))))}},(((((.........)))))......................)))))))...)))....
Forensic Context
No forensic context available.