Basic Information
Symbol
hsa_SHKBP1_0003600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0051114
hsa_circSHKBP1_022
Host gene
SHKBP1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
19:41096882-41097305
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:40590976-40591399
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-151.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-157.87 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
63.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....(((((((((((((((.......))).)))).....(((((.((....))..)))))))))))))....)).(..(((((((((((....(((.((((((((.(((((((..((((..(((.((((((((((.(.((.((((((.............)))))).))..).))))).)))...)).))).))))...(((((.((((..........)))).)))))......((((..(((((....((..((((.(((((((((((((((((.(((((......))))).)))).((((...))))...))))))))))))).)))).)).....)))))..))))....((((....)))).......))))))).)))....)).....))).)))....)))))))))))...).
Thermodynamic Ensemble Prediction
((....(((((((((((((((.......})).)))).....(((((.((....)).,)))))))))))))....)).(..(((((((((((....(((.(((..((({({{(((,..((((.,(((.({((((((((.{.((.((((((.............)))))).))..).))))).))).,,)),)}).)))),,,(((((.((((.,........)))).)))))......||||,.(((((....((..((((.(((((((((((((((((.(((((......))))).)))}.{(((...)))}...))))))))))))).)))).)).....)))))..,}}}....{(((....}}}}.......,,,,})).}))....},.....))).)))....)))))))))))...).
Forensic Context
No forensic context available.