Basic Information

Symbol
hsa_SHKBP1_0002500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SHKBP1_0013
Host gene
SHKBP1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
19:41089518-41095031 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:40583612-40589125 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-165.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -176.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 147.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((((.((...(((((........))))).((..(.(((....))).)..))((.((.((((((...(((.....)))...)))))).)))).....))))).))).)))))((((((.(((..(((...((((.((.(((((((((((......(((((.((.((((((..((((((((.(((((...)))))))).)))))(((.......)))((((((((.((((.(((....(((((((((((.((((..(((...(((...(((.((((((((.((.(......)))))).))))).))))))...)))))))))))))))))).......(((.(((((((..(((....(((.....)))....)))...)))))))))).)))))))...)))).)))))))))))).)))))....))))))....))))).))..).)))....))))))))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,{{{{(((({{.{{...((({{.,.,,,|,}}|||..({,,,.,..,})})}}...},|||||.{(((({,.,,||}}.,.|||{{{.|{{{{{{.....,.({{((|{(|{{|||.,(((((,.(((...((({.,(((.(({((((.((({((,((((,{,..|}|}}}|)}.))),))|.)}}.}|}}|..}))),,,,.})),)))}}..,,,}})))|((((.((((((,.(({....(((((((((((.((((..(((...(((,..(((.((((((((.(,,{......)))))).))))).))))))...))))))))))))))))))...((({,,(((((((((..(((....(({.....}))....)))...))))))))),...))))..)))})))))).)))).,,,.....)})))),}.,...)))))),}))}}}.},,}},,),}|}|,},}.,,,}
Forensic Context

No forensic context available.