Basic Information
Symbol
hsa_SHPRH_0004700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0078137
hsa_circSHPRH_008
Host gene
SHPRH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
6:146209156-146261937
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:145888020-145940801
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-692.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-739.76 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
915.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((((((...(((.(((..((((((((...(.(((.(((((...((((.(.(((....((.((((((((((((((((((((.((((.((((((((((((....((((((((..(.((((...)))).)..))))))))(((((....(((.....)))..)))))......(((.((((((((((..((........))..)))))))))))))..))))))).((.((((.....))))))......))))).))))((((((((.(.((...((((((.......)))))).))).)))))).))........((((.(((.(((((((((((((((((((((...(((.((.....(((((.(((((((((((...)))).))))))).)))))((.(((((((.((((((..((.......((((((((((.(((((..((((((((..(((((((((((((((((((.((....))..))))).........))))))))))....((((((((.(((((((....))))((((..........))))))))))))))).))))...(((((((....((((.(((.((.(((........))).)).))))))).....)))))))........(((((......)))))))))))))..)))).).)))..(((((.(.(((....))))))))).((((((...(((....)))))).)))......))))).))........))..))))))...).))))))))......)).))).)))))))...(((((((..(((((..(((....))).)))))....)).))))).(((((.........)))))......((((((((((.....)))).)))))))))))))).)))))).)))...))))........))))))))))..))))))))))))))).)))))...((((.((((((..((((((......)))))).......(((((((..((..(((.....((.......)).....)))..))......(((((((.((((((.......)))))).)....(((((((.((............))))))))).......)))))).)))))))....((((((((........(((((....))))).((((.........))))...((((((((((((((.(((((((((((.((............)))))).)))........((((..(((.((((.(.....).)))).))).))))...........(((((........)))))..........)))).))))))..(((((.(((((((.((((((((((((.((((((.......(((((.....)))))............((((((.(((((((((.(((((.((.(((((.(((((.((((((.......))).))).))))).))))).)).....((((.(((..((.....))..))).))))...........)))))))))).......)))).)))))).....((((.(((..(((((((.........))))))).)))..))))...)).)))).))))).((((.........))))))))))).)))))))...)))))......(((..(((((.................)))))..))).....))))))))......))))))))........((((((..(((((((((...........)))))))))))))))....((((((....))))))....(((.(((..(((((..((((..((.........))..)))))))))))).)))..))))))))))(((((..((((((((.....)))....))))).)))))))))).))).))))))))).)))))))))))..........))))).))(........(((((.......((((.(((((((((..((.(.((((((((...((....)).((.(..((((....))))..)))..(((((....)))))((((((((((((....))))).....)))))))..........(((((....)).)))))))))))...).)).))))))))).))))............(((((.(((((....(((((((...((((.....(((((.(((((((..((((.....(((((((..(((((........((((......))))......))))).(((....)))...)))))))))))..))))).)).))))).)))).)))))))...))))))))))(((..(((.(((((.((((((.(((...)))))).))))))))....)))..)))...........((.(((((((......................))))))).)).......((((.............)))))))))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({(,,...,|||(({{(({((,,({({{,{,..,{,,{({((({{{,,{{(({{{{{({(,.{({(((({{{{(((((((((((({(((({(,{((({{{{{{,{..((((((((.{(,((((...)))).)}})))))))).{{{{,,..{||,,..,))},,)))))},,,,,|{{.((((((((((..,{,.,.....)),,)))))))))}|}},.,})}}}}}|,.{|||,,,,.}}}}},..{{{{{||||{..,,,,{{{{{{.,.{{{{,((((((.......}})))}.|},.}))))),}}.,{,.{{,{{{|.{{|}|||||{|{||,||||||||||...,{({(({,,,,(((((.(((((((((((...)))).))))))).)))))|{.,,{{{,|,|||,||}}|{,.....,||(((((((({{{{{({.(((((({{..,{((((({(((((((({((.(({{{,||..}}}||,,.....,,))},||||||{{..((((((((.(({((((....)))),{(({,{,..,.,,}}}}})))))))))}.))))..}||,(((({...,{{|}|||.{{.(((,.{,,{{.||},||.}}}}|||,,..{||}}|||{........(((({.{,{{}||||{(|,((||..||||.|.,,|..(((((.{.(((....)))})))))..,{{,,...|{,....|||,}}.}})}.....}}}},.}}...,,{|.,,..|))))|..,|||}}}}}}},.}}..))}))},)))))))}..,,{{,||},{{|||..|{{,,,.}}),))))),}}}}}|)))))}||,||.}}|},}}},}||}......((((((((((.....))))}}})))),},})))),))))))}})).{{{{|},|||||{{{||,||||||{{||||,,||||{|||{{|(({...{,,{.,{|,|{...((((((......)))))).}}.|||{|,.|||,|||,,|{||,{,.,||....,,||{{,..{{{.{||......(((((((,((((((,{,,..,||}|||,,....{{{||||.||,..........,))})))))).......))))))..))),})}.{{{{((,,{{........(((((,,,,}}}}}.{{{{,........,|||,{{{,..,|{{{{(||,.||||||{,{{,,||}}..}}}}}}..,))))).})),}}}},,.,||||.{{{.,,{|||,,.,.,.,}}},}}}.})))...........(((((........))))).......,}}))))}}},)))}...,,..,,.((,,{(((((,((...,..||,}}}))}}}.(((((|...})))))({{{{{((..((((,,{.((((((((...((((.....,,,,|}||,,,.{,,|||}}}}}...)))),,})))))}),|||{|......))))}}))))))}))))))}))})})}.|{{(,(((,,.,|||{||||{{{,....,||}|{|||||,{{{,.(((({({({{{{{((((.,......,|}}}})).,}}..,}}}}..}}}}}))})))))}|,,|}}}}},...}}},}}}}}}}||||||||,..|||,}},....{{{..((({{........,........}}}}}..}}}...,{{(((|||,.....,))))))),........((((((..(((((((((...........)))))))))))))))....{{{{{|.,.,)))|||,{{{(((,((({,(((((..((((..((.........))..)))))))))}||.}||||}||{||||..{(((({,(({({{,,,....,,,....}}}}}.))},}..,.,|||},||||,,||||,,,}},,,,,,..|||}||,}}})}}})),.))))))),,||.....||...,,.,.(((((({..((((.,.{........},..))))})))))){{((....)))|{{{(,.{(((((....)))))|||||({(((((....))))).....}})))))}.|||{..,.(((((....)).}}},||,)}}}...|,||{{{{||||,...{|.......}}....{{(({{,((({....{((((((...(({{.....{{,{|,|||||{{..{,{{,,,|,|||{{||.,{{{{{........((({......)))),,,,},)))))}|||,},,}}}...))))))),,))}}))))).,)})))))}))))}),)))))},,}}))))))))},,...{{.(((((.((,(((.(((...)))))).)),))))).}},,....||}.....,,....((.(((((((.....,{,,....,,,......))))))).))......,||{|,,..,,)}}....}})))),}}},,}
Forensic Context
No forensic context available.