Basic Information

Symbol
hsa_SHPRH_0004000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SHPRH_0146
Host gene
SHPRH
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
6:146207925-146209155 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:145886789-145888019 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-298.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -320.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 323.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((....))))))).((((((.(((((((.((.((..(((((....(((((((((...(((....)))....))))....))))).....)))))..)).)).)))......((((((((((..((.(((.......((((.....))))))).))..)))))))))).......((((((....)))))).....(((((..((((...)))).)))))...(((((((..((((.........(.(((((((..........))))))).)))))..))))))).))))...))))))............((((((.((((((((((.....)))))).))))..))))))..(((((..((((((((((((((..(((...(((((.(.(((((..(((((((.(((......).)))))))))))))).))))))..(((((.....))))).............................(((((((((((...((((..((((........))))..)))).......((((((.....))))))...........((((((((((..((((((((...........))))))))((((((((..((((..((.(((((......(((((((((((.(((...))).))))).))))))(..((((((.(((((((((.(.....((.((((((((.....(((.((.((......)).)).)))..(((((((((.((.......)).)))))))))..(((((((((((((......)))))))))).)))............)))))))).))...).))))))))).))))))..)))))).))..))))..)))))))).......(((((((........)))))))....(((....)))((((((((.((((.........)))).))))))))(((((....))))).....))).))))))).(((((.((((((((.(........).)))))))))))))(((((...........))))).................)))))))))))......))).))))))....)))))))))))))((((..(....)..)))).......................(((((...((((.......))))...)))))...(((...)))..((((((((((..(((......)))...))))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((((....))))),,.{(((((.{(((,,(((,.,,|||,,,....{{((((((((...({{....}}}....))))},}}}}....,,,.,{{{,,....,.|}}|{{{,,.((((((((((..((.(((.......((((.....))))))).))..))))))))))...}}}}||,{{{,...}}}}}},,...{((((..{{{,...}}},.))))}...,{(((((..((((.........,.(((((((..........))))))),}))))..))))}}|.|}})...}}}}}}............((((((.((((((((((.....)))))).))))..)))))){,(({({.,,(((({{{,{{,{{|}||,,.,|||{{,(,(((((..(((((((.(((......).)))))))))))))).)))|||,.{((((.....)))))},},,......................,{(((|||.||||}..((((..((((........))))..))))...{{,,((((((.....})))}|...........,|||||||||}.((((((((...........))))))))........,{{{{{...,))))}}......(((((((((((.(((...))).))))).))))))(..((((((.(((((((({,(,...,,({(,.,.|||,},,|||,.,..((......)).,}.},...(((((((((.((.......)).)))))))))..(((((((((((({......)))))))))).)))....,,.,|,,{|||,,,,)}))},.),))))))))).))))))..),||||{||{{||{{{,{|{((((((({...,}}}))}}...,,.{{|||||||,,|.|||...,}},{((((((|.((((.........)))).}))))))|(((((....))))},.,.,,.,..((((({.(((((.((((((((.(........).))))))))))))),}}}}))).....,,.|||||,.....,,{{{,{|||,}|||},}}})},,......},))))))}}..}))))))}},,,|((((..{....}..))))}...........,,,,,,....,{{{{|,,.{{{{..,||,,,}}}..,))),}}}}}}}}}.,}}.||||||{{|{{..{{{..,,,,)})...))))))))))}}.
Forensic Context

No forensic context available.