Basic Information

Symbol
hsa_SHPRH_0006900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SHPRH_0085
Host gene
SHPRH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
6:146215286-146256577 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:145894150-145935441 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-600.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -639.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 730.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((.((((.((((((((((((....((((((((..(.((((...)))).)..))))))))(((((....(((.....)))..)))))......(((.((((((((((..((........))..)))))))))))))..))))))).((.((((.....))))))......))))).)))).)))))....(((((((((......(((..(((((...((((((...((((((....((((.(((.(((((((((((((((((((((...(((.((.....(((((.(((((((((((...)))).))))))).)))))((.(((((((.((((((..((.......((((((((((.(((((..((((((((..(((((((((((((((((((.((....))..))))).........))))))))))....((((((((.(((((((....))))((((..........))))))))))))))).))))...(((((((....((((.(((.((.(((........))).)).))))))).....)))))))........(((((......)))))))))))))..)))).).)))..(((((.(.(((....))))))))).((((((...(((....)))))).)))......))))).))........))..))))))...).))))))))......)).))).)))))))...(((((((..(((((..(((....))).)))))....)).))))).(((((.........)))))......((((((((((.....)))).)))))))))))))).)))))).)))...))))........(((((((.....)))..))))...))))))..))))))..))))).)))((((((......))))))....)))))))))((((.(((.((....((((((((........(((.(((......(((((((.((((((.......)))))).)....(((((((.((............))))))))).......))))))..))).)))...((((((((........(((((....))))).((((.........))))...((((((((((((((.(((((((((((.((............)))))).)))........((((..(((.((((.(.....).)))).))).))))...........(((((........)))))..........)))).))))))..(((((.(((((((.((((((((((((.((((((.......(((((.....)))))............((((((.(((((((((.(((((.((.(((((.(((((.((((((.......))).))).))))).))))).)).....((((.(((..((.....))..))).))))...........)))))))))).......)))).)))))).....((((.(((..(((((((.........))))))).)))..))))...)).)))).))))).((((.........))))))))))).)))))))...)))))......(((..(((((.................)))))..))).....))))))))......))))))))........((((((..(((((((((...........)))))))))))))))....((((((....))))))....(((.(((..(((((..((((..((.........))..)))))))))))).)))...(((((((..(((((..((((((((.....)))....))))).))))).....(((..((((..((((..............))))..))))..)))..)))))))(((.....))).((((.(((((((((..((.(.((((((((...((....)).((.(..((((....))))..)))..(((((....)))))((((((((((((....))))).....)))))))..........(((((....)).)))))))))))...).)).))))))))).)))).))))))))...)).))).))))....(((((((...((.....))....)))))))............
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((.,,,(((((((((.,..{(((((((.{(,((((...)))).)}})))))))},((((((..(((.....)))..))}})},....(((.((((((((((..{(.,,.....))..)))))))))))))}.})))))))|{.((((.....))))}...((((((((({..,,,|{{{{{{.,.((,,,((((((.......)))))).,}|,|}}}}}.||,((,.(({(((,.,,|)))))),|,)}.)))))))))).,}}}}}}}}}}}}(((((.(((((((((((...)))).))))))).))))|((.,((({.{{(({.{{{{(.......,,{{({{(.,.,(((({{{{{(|{{||..{{{{{((((((((((((((.((....}}..))))).........)))))))|||....{(((({((.(({((((....)))){{(({{{,..,.,.|}}}}))))}}}}}},))))..,||,,{{(,..,{((({(({.((,{{{..,,,,,,))),)).}))))}},,,}|))|||||.........,,(({{{.,||}}|((((.((((,,((((((.,,,..(((((.{.(((....)))})))))..{{{,,...|{,....|||,}}.}}),...,.,,,,,.|,........{(((((((((.,{{{{{{{,|{{(.{({({{{((|.{{||.||{{{||||,{{,.(((((..(((....))).))))).,}{{{({|,,|{(((({.,,{,.{,,||}||......((((((((((.....))))}||})}},|.||||,.}|||||{|{{,((((|..((((((((({.,((((((({{{,..{(((((({{({({{...|||,.||}}},...((((((......)))))).,|.|||||||||(((({.,,{(({{,,.{{....,.{{((,..{{{.{{{......(((((((,((((((,{,,..,||}|||,,....,{{||||.||,..........,))})))))).......))))))..))),})}.{{((((..{{........(((((,,,,|}}||.{{{,.......,.,|||{{{{,..,||{{{{||..|||||||,,|,,||}}..}}}}}}..,))))).})),}}}}}}.,|||},{{{.,{{|||,....,.,}}},}}}.}))),,.........(((((........))))).......,}}))))},},)))}...,...,..((..{(((((.((......}}.}}}))))).(((((|...})))))((((((((..((((..,.((((((((...((((.........))))....,..))))))))...))))..)))))))).{((((......))))}})))))))))))))))),},},.((((.(((....))).))))........|||}||||}}}}|||,.{{{{|{|||||||({{(,|,.....|||}||)),,}},.,}}},..|,||,|||,|||,.{{((.........)))})))))))}|))}|||,..||,,|},....{{{..((({{........,........}}}}}..}}),,.,||||||}|,....,}))))))},........((((((..(((((((((...........)))))))))))))))....((((((....))))))....{{{.|||,,||{||..{{||}}||..,}}},..},..}}})))))}))),,}}.}}})|)))|..{(((({,(({{{{,,,....,,|....}}}}}.}}},}.....}}|))},}},,,)))},,,,))))))))))))))))))))).)))}}.,}}))}}))}}..,||..,,|.,,{|||||,..||||,|.{,,,,,...,},})}))}}),},,{|({....}}||,.|||{{{((((....))))|((((((((((((....))))).....)))))))}.((({....(((((....)).)))....))))...)}))},}||}|||,.,|},..},,.)),...)))))),}||}....,{{{(({..,{{,....,,....}}))))}..}},,.,}}})
Forensic Context

No forensic context available.