Basic Information

Symbol
hsa_SHPRH_0007800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SHPRH_0113
Host gene
SHPRH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
6:146231584-146244880 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:145910448-145923744 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-268.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -287.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 232.77
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((......))))))....((((((.((((((.(((((.(((.((((...(((.((((.(((..(.(((...((((((((....)).))))))....)))).))).))))...))).)))).))).))))).........(((((((.((.......((..(((((((.(((....((((((((........(((((....))))).((((.........))))...((((((((((((((.(((((((((((.((............)))))).)))........((((..(((.((((.(.....).)))).))).))))...........(((((........)))))..........)))).))))))..(((((.(((((((.((((((((((((.((((((.......(((((.....)))))............((((((.(((((((((.(((((.((.(((((.(((((.((((((.......))).))).))))).))))).)).....((((.(((..((.....))..))).))))...........)))))))))).......)))).)))))).....((((.(((..(((((((.........))))))).)))..))))...)).)))).))))).((((.........))))))))))).)))))))...)))))......(((..(((((.................)))))..))).....))))))))......))))))))........((((((..(((((((((...........)))))))))))))))....((((((....)))))).....((.(((..(((((..((((..((.........))..)))))))))))).))((((...))))))))))))))..))....)).))))))).....))))))........((((....))))...)))))).....(((((...((((....)))).))))).(((((..((.........((((((..((((................))))))))))))..)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((......))))))....((((((.((((((.(((((.(({.((({...{((.((({.{((..{,,,{...(((((({{....|}.))))))....}}},.})}.))))...))).)))).|)).})))}.........{{{{{{{,||........{{,{((((((.(({....((((((((........(((((....))))).{{{{.........}}|}...((((((((((((((.(((((((((({,((............)))))).)))....,...((((,.(((.,,{{|{,..,.,.}}}},))}.))))...........(((((........))))),,.....,,.)))).)))))),.(((({.(((((((.((((((((((((.((((((.,{.{..{{{|||,,.|)}}}}......}}}...((((((.((((((({{,(({,,.((.(((((.(((((.((((((.......)))}})).))))).))))),)}..,,.((({.{{{..{{.,,,})}..}}}.}}}|,,,.,,,....)))}))))},......,)))).)))))).,,..((((.(((..(((((((.........))))))).)))..}))),..)).)))).))))).{(((.........))))))))))).)))))))...))}}}......(((..(((((.................)))))..))).....})))))))......))))))))........((((((..(((((((({...........)))))))))))))))....((((((....))))))....,{(.(((..(((((..((((..((.........))..)))))))))))).)}|(((...))))))}))))))),,,}....)).)))))}).....}}))))........((({....})))...)))))).....(((((...((((....)))).))))){(((((..({......,.{((((({..((((...{........,...))))}))))))}..))))}.}
Forensic Context

No forensic context available.