Basic Information

Symbol
hsa_SHPRH_0010700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-SHPRH_0106
Host gene
SHPRH
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
6:146243799-146263010 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:145922663-145941874 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-437.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -467.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 401.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((..(((((((((........)))))))....(((((..((((((...((((.((((((((((.....)))))).)))).))))...........(((((..((((((((.((....))))).))))))))))(((((((((.(((((..(.(((...(((.....)))))))..)))))..)))))).)))........))))))..))))).((((((....))))))(((((((..((((.((((((....))...)))).)))).)))))))...))..))))))))((((.((((((((.((.((.((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((((....((((((((..(.((((...)))).)..))))))))(((((....(((.....)))..)))))......(((.((((((((((..((........))..)))))))))))))..)))))))))...))))))).........((((((((((....((((((((.(.((...((((((.......)))))).))).)))))).)).((..((((((.....))))))...)).)))))))))).....((((((((((((((.(((((((((((...)))).))))))).))))))..........))).)))))..........(((((((((....((.((((((.....((((((.((((((((.((.((((((((....((......))..((((....))))...((((((((.((....)))))..............(((((((....((((.(((.((.(((........))).)).))))))).....))))))).(((((..(((((...(((((.((((.((((((..((....((((.(((....(((((.(.(((....))))))))).((((((...(((....)))))).))).................((((......)))).....)))))))....))..))))))))))))))))))))..)))))((((..(((....))).))))...))))))))))))).)).))))))))...........((((((((((.....)))).))))))....)))))))))))).)).....))))))))).))))))))))..)))))))))))))).))(((.(((..(.(((.((...((((((......)))))).)).))).)..))).)))))))))....................(((.(((......((((((((((((((((((.....((((.....(((((.((....)).)))))...)))).....)))..))).)))))).......))))))..))).))).((((((..((........(((((((((...(((......)))......((.(((...))).))))).)))))).........))..)))))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.,,{{{,((,(((((((,,,....,)))))}},.{{(({((,,((({,,...((((.((((((((((.....)))))).)))).))))...........{{(({..{{((((((.{|....,}))).))))||||,|{||{(((((,,(({,.,{{(((...{(({{..,,.,}))}..}}))),})))))},})},},|.||.}}}})),|}}}},.(((((,....||}}}}(((((((..((((.(((({,....,}...)))).)))).)))))))...,},.|{||{|,(((.{.(((((({{.{{,((.((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((((.,..{(((((((.{(,((((...)))).)}})))))))).(((({{..(((.....)))..)))))},....(((.((((((((((..{(..,.....)),,)))))))))))))}.})))))))}...))))))).........((((((((((..,.{,((((((.,.((...((((((.......)))))).})}.)))))).}}.{{,.((((((,...,)))))),}.)).)))))))))).....((((({{{{{((((.(((((((((((...)))).))))))).))))}|,...,.....})}.))))|,,.....,,,(((((((((....((.((((((.....{(((((.((((((((.{(.((((((((,...,,......)),.((((....))))...,,(((({,,{,,,{{{}}}).,,...|}}|,...(({{(((....{{{|,|{{,({,(((,.,,,,,.||},||.}}}}|||,,..,||}}}}|,.,,,,..(((((,..{((((.((((.((((((.,((,,...,{{.....,,,(((((.{.(((....)))})})})..,{,,....|{,....}}|,}}.}})}....,,,}}.,}}}..((((......))))...,|||},.,,...,))..))))))))))))))))))))..}))}|{|||..{{{,,,.}}).))))),,))))))))))))).)}.)))))))).,{,....,}.((((((((((.....)))))}}))))....)))))))))))).)).....))))))))).))))))))))..)))))))))))))).))(((.(((..(.(((.((...((((((......)))))).)).))).)..))).))))))))).,..}}}.,,.}})}{{........}}......(((((((({{{({{{{||,,|.{{{{|,,,,|||,.|}||,,},)}})|||||{,,|},.........,}))})))))).......))))))..)){{{{..((((((..||........((((({{{,}}}}|.,,,,.........,}||,{{{...,,|,|,|}}.}}})}),,..,,}},)),,)))))).))))
Forensic Context

No forensic context available.